Protein–RNA interactions for Protein: O35448

Ppt2, Lysosomal thioesterase PPT2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppt2O35448 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppt2O35448 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppt2O35448 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppt2O35448 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppt2O35448 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppt2O35448 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppt2O35448 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppt2O35448 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppt2O35448 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppt2O35448 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppt2O35448 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppt2O35448 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppt2O35448 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ppt2O35448 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppt2O35448 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppt2O35448 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppt2O35448 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppt2O35448 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppt2O35448 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppt2O35448 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppt2O35448 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppt2O35448 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppt2O35448 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppt2O35448 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppt2O35448 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppt2O35448 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppt2O35448 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppt2O35448 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppt2O35448 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppt2O35448 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppt2O35448 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppt2O35448 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppt2O35448 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppt2O35448 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppt2O35448 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppt2O35448 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppt2O35448 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppt2O35448 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppt2O35448 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppt2O35448 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppt2O35448 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppt2O35448 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppt2O35448 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppt2O35448 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppt2O35448 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppt2O35448 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppt2O35448 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppt2O35448 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppt2O35448 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppt2O35448 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppt2O35448 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppt2O35448 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppt2O35448 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppt2O35448 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppt2O35448 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppt2O35448 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppt2O35448 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppt2O35448 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppt2O35448 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppt2O35448 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppt2O35448 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppt2O35448 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppt2O35448 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppt2O35448 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppt2O35448 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppt2O35448 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppt2O35448 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppt2O35448 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppt2O35448 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppt2O35448 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppt2O35448 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppt2O35448 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppt2O35448 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppt2O35448 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppt2O35448 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppt2O35448 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppt2O35448 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppt2O35448 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppt2O35448 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppt2O35448 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppt2O35448 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppt2O35448 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppt2O35448 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppt2O35448 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppt2O35448 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppt2O35448 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppt2O35448 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppt2O35448 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppt2O35448 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppt2O35448 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ppt2O35448 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppt2O35448 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppt2O35448 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppt2O35448 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppt2O35448 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppt2O35448 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppt2O35448 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppt2O35448 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppt2O35448 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppt2O35448 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.4 ms