Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh2d1bO35324 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh2d1bO35324 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh2d1bO35324 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh2d1bO35324 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh2d1bO35324 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh2d1bO35324 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh2d1bO35324 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh2d1bO35324 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh2d1bO35324 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh2d1bO35324 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh2d1bO35324 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh2d1bO35324 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sh2d1bO35324 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh2d1bO35324 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh2d1bO35324 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh2d1bO35324 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh2d1bO35324 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh2d1bO35324 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh2d1bO35324 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh2d1bO35324 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh2d1bO35324 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh2d1bO35324 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh2d1bO35324 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh2d1bO35324 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh2d1bO35324 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh2d1bO35324 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh2d1bO35324 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh2d1bO35324 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh2d1bO35324 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh2d1bO35324 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh2d1bO35324 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh2d1bO35324 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh2d1bO35324 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh2d1bO35324 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh2d1bO35324 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sh2d1bO35324 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh2d1bO35324 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh2d1bO35324 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh2d1bO35324 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh2d1bO35324 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh2d1bO35324 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh2d1bO35324 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh2d1bO35324 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh2d1bO35324 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh2d1bO35324 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh2d1bO35324 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh2d1bO35324 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh2d1bO35324 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh2d1bO35324 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh2d1bO35324 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh2d1bO35324 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh2d1bO35324 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sh2d1bO35324 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Sh2d1bO35324 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sh2d1bO35324 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh2d1bO35324 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh2d1bO35324 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh2d1bO35324 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh2d1bO35324 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh2d1bO35324 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh2d1bO35324 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh2d1bO35324 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh2d1bO35324 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh2d1bO35324 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh2d1bO35324 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh2d1bO35324 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh2d1bO35324 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh2d1bO35324 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh2d1bO35324 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh2d1bO35324 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh2d1bO35324 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh2d1bO35324 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh2d1bO35324 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh2d1bO35324 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh2d1bO35324 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh2d1bO35324 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh2d1bO35324 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sh2d1bO35324 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh2d1bO35324 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh2d1bO35324 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh2d1bO35324 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh2d1bO35324 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh2d1bO35324 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh2d1bO35324 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh2d1bO35324 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh2d1bO35324 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh2d1bO35324 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh2d1bO35324 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh2d1bO35324 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh2d1bO35324 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh2d1bO35324 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh2d1bO35324 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh2d1bO35324 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh2d1bO35324 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh2d1bO35324 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh2d1bO35324 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh2d1bO35324 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh2d1bO35324 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh2d1bO35324 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms