Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NmiO35309 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NmiO35309 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NmiO35309 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NmiO35309 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NmiO35309 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NmiO35309 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NmiO35309 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NmiO35309 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NmiO35309 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NmiO35309 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NmiO35309 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NmiO35309 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NmiO35309 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NmiO35309 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NmiO35309 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NmiO35309 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NmiO35309 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NmiO35309 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NmiO35309 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NmiO35309 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NmiO35309 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NmiO35309 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NmiO35309 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NmiO35309 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NmiO35309 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NmiO35309 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NmiO35309 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NmiO35309 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NmiO35309 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NmiO35309 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NmiO35309 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NmiO35309 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NmiO35309 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NmiO35309 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NmiO35309 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NmiO35309 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NmiO35309 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NmiO35309 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NmiO35309 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NmiO35309 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NmiO35309 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NmiO35309 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NmiO35309 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NmiO35309 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NmiO35309 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NmiO35309 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NmiO35309 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NmiO35309 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NmiO35309 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NmiO35309 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NmiO35309 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NmiO35309 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NmiO35309 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NmiO35309 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NmiO35309 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NmiO35309 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NmiO35309 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NmiO35309 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NmiO35309 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NmiO35309 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NmiO35309 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NmiO35309 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NmiO35309 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NmiO35309 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NmiO35309 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NmiO35309 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NmiO35309 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NmiO35309 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NmiO35309 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NmiO35309 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NmiO35309 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NmiO35309 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NmiO35309 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NmiO35309 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NmiO35309 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NmiO35309 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NmiO35309 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NmiO35309 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NmiO35309 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NmiO35309 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NmiO35309 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NmiO35309 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NmiO35309 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NmiO35309 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NmiO35309 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NmiO35309 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NmiO35309 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NmiO35309 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NmiO35309 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NmiO35309 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NmiO35309 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NmiO35309 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NmiO35309 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NmiO35309 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NmiO35309 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NmiO35309 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NmiO35309 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NmiO35309 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NmiO35309 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms