Protein–RNA interactions for Protein: O35226

Psmd4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd4O35226 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmd4O35226 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psmd4O35226 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psmd4O35226 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psmd4O35226 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psmd4O35226 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psmd4O35226 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psmd4O35226 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Psmd4O35226 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psmd4O35226 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psmd4O35226 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psmd4O35226 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Psmd4O35226 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psmd4O35226 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Psmd4O35226 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Psmd4O35226 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmd4O35226 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmd4O35226 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmd4O35226 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmd4O35226 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmd4O35226 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmd4O35226 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmd4O35226 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psmd4O35226 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psmd4O35226 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psmd4O35226 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Psmd4O35226 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psmd4O35226 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psmd4O35226 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmd4O35226 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmd4O35226 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmd4O35226 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmd4O35226 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psmd4O35226 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psmd4O35226 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psmd4O35226 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psmd4O35226 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psmd4O35226 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psmd4O35226 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psmd4O35226 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Psmd4O35226 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Psmd4O35226 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psmd4O35226 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Psmd4O35226 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psmd4O35226 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Psmd4O35226 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psmd4O35226 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psmd4O35226 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psmd4O35226 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psmd4O35226 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psmd4O35226 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psmd4O35226 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psmd4O35226 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psmd4O35226 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psmd4O35226 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmd4O35226 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmd4O35226 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmd4O35226 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmd4O35226 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmd4O35226 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmd4O35226 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Psmd4O35226 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psmd4O35226 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psmd4O35226 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psmd4O35226 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmd4O35226 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmd4O35226 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmd4O35226 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmd4O35226 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmd4O35226 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmd4O35226 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmd4O35226 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmd4O35226 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmd4O35226 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psmd4O35226 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psmd4O35226 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psmd4O35226 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmd4O35226 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmd4O35226 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmd4O35226 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmd4O35226 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmd4O35226 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmd4O35226 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmd4O35226 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmd4O35226 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmd4O35226 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmd4O35226 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmd4O35226 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmd4O35226 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Psmd4O35226 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Psmd4O35226 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psmd4O35226 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psmd4O35226 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psmd4O35226 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmd4O35226 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmd4O35226 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmd4O35226 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmd4O35226 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmd4O35226 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmd4O35226 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms