Protein–RNA interactions for Protein: O09053

Wrn, Werner syndrome ATP-dependent helicase homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WrnO09053 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
WrnO09053 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
WrnO09053 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
WrnO09053 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC36.46■■■■□ 3.43
WrnO09053 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
WrnO09053 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
WrnO09053 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
WrnO09053 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
WrnO09053 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
WrnO09053 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
WrnO09053 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
WrnO09053 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
WrnO09053 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
WrnO09053 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
WrnO09053 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
WrnO09053 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
WrnO09053 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
WrnO09053 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
WrnO09053 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
WrnO09053 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
WrnO09053 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
WrnO09053 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
WrnO09053 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
WrnO09053 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
WrnO09053 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
WrnO09053 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
WrnO09053 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
WrnO09053 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
WrnO09053 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
WrnO09053 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
WrnO09053 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
WrnO09053 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
WrnO09053 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
WrnO09053 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
WrnO09053 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
WrnO09053 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
WrnO09053 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
WrnO09053 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
WrnO09053 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
WrnO09053 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
WrnO09053 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
WrnO09053 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
WrnO09053 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
WrnO09053 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
WrnO09053 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
WrnO09053 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
WrnO09053 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
WrnO09053 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
WrnO09053 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
WrnO09053 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
WrnO09053 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
WrnO09053 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
WrnO09053 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
WrnO09053 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
WrnO09053 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
WrnO09053 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
WrnO09053 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
WrnO09053 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
WrnO09053 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
WrnO09053 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
WrnO09053 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
WrnO09053 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
WrnO09053 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
WrnO09053 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
WrnO09053 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
WrnO09053 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
WrnO09053 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
WrnO09053 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
WrnO09053 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
WrnO09053 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
WrnO09053 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
WrnO09053 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
WrnO09053 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
WrnO09053 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
WrnO09053 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
WrnO09053 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
WrnO09053 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
WrnO09053 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
WrnO09053 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
WrnO09053 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
WrnO09053 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
WrnO09053 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
WrnO09053 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
WrnO09053 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
WrnO09053 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
WrnO09053 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
WrnO09053 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
WrnO09053 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
WrnO09053 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
WrnO09053 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
WrnO09053 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
WrnO09053 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
WrnO09053 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
WrnO09053 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
WrnO09053 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
WrnO09053 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
WrnO09053 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
WrnO09053 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
WrnO09053 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
WrnO09053 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms