Protein–RNA interactions for Protein: O09009

Rfng, Beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase radical fringe, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfngO09009 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RfngO09009 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RfngO09009 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RfngO09009 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RfngO09009 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RfngO09009 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RfngO09009 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RfngO09009 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RfngO09009 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RfngO09009 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RfngO09009 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RfngO09009 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RfngO09009 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RfngO09009 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RfngO09009 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RfngO09009 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RfngO09009 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RfngO09009 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RfngO09009 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RfngO09009 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RfngO09009 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RfngO09009 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RfngO09009 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RfngO09009 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RfngO09009 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RfngO09009 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RfngO09009 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RfngO09009 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RfngO09009 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RfngO09009 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RfngO09009 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RfngO09009 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RfngO09009 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RfngO09009 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RfngO09009 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RfngO09009 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RfngO09009 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RfngO09009 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RfngO09009 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RfngO09009 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RfngO09009 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RfngO09009 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RfngO09009 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RfngO09009 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RfngO09009 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RfngO09009 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RfngO09009 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RfngO09009 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RfngO09009 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RfngO09009 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RfngO09009 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RfngO09009 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RfngO09009 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RfngO09009 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RfngO09009 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RfngO09009 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RfngO09009 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RfngO09009 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RfngO09009 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RfngO09009 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RfngO09009 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RfngO09009 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RfngO09009 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RfngO09009 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RfngO09009 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RfngO09009 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RfngO09009 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RfngO09009 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RfngO09009 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RfngO09009 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RfngO09009 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RfngO09009 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RfngO09009 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RfngO09009 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RfngO09009 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RfngO09009 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RfngO09009 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RfngO09009 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RfngO09009 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RfngO09009 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RfngO09009 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RfngO09009 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RfngO09009 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RfngO09009 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RfngO09009 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RfngO09009 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RfngO09009 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RfngO09009 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RfngO09009 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RfngO09009 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RfngO09009 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RfngO09009 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RfngO09009 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RfngO09009 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RfngO09009 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RfngO09009 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RfngO09009 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RfngO09009 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RfngO09009 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RfngO09009 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms