Protein–RNA interactions for Protein: O08785

Clock, Circadian locomoter output cycles protein kaput, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClockO08785 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClockO08785 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClockO08785 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClockO08785 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClockO08785 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClockO08785 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClockO08785 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ClockO08785 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ClockO08785 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ClockO08785 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ClockO08785 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ClockO08785 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ClockO08785 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ClockO08785 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ClockO08785 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ClockO08785 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ClockO08785 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ClockO08785 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ClockO08785 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ClockO08785 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ClockO08785 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ClockO08785 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ClockO08785 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ClockO08785 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ClockO08785 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ClockO08785 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ClockO08785 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ClockO08785 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ClockO08785 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ClockO08785 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ClockO08785 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ClockO08785 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ClockO08785 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ClockO08785 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ClockO08785 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ClockO08785 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ClockO08785 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ClockO08785 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ClockO08785 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ClockO08785 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ClockO08785 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ClockO08785 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ClockO08785 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ClockO08785 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ClockO08785 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ClockO08785 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ClockO08785 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ClockO08785 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ClockO08785 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ClockO08785 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ClockO08785 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ClockO08785 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ClockO08785 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ClockO08785 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ClockO08785 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ClockO08785 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ClockO08785 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ClockO08785 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ClockO08785 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ClockO08785 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ClockO08785 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ClockO08785 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ClockO08785 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ClockO08785 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ClockO08785 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ClockO08785 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ClockO08785 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ClockO08785 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ClockO08785 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ClockO08785 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ClockO08785 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ClockO08785 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ClockO08785 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ClockO08785 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ClockO08785 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ClockO08785 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ClockO08785 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ClockO08785 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ClockO08785 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ClockO08785 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ClockO08785 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ClockO08785 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ClockO08785 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ClockO08785 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ClockO08785 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ClockO08785 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ClockO08785 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ClockO08785 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ClockO08785 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ClockO08785 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ClockO08785 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ClockO08785 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ClockO08785 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ClockO08785 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ClockO08785 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ClockO08785 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ClockO08785 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ClockO08785 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ClockO08785 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ClockO08785 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms