Protein–RNA interactions for Protein: O08784

Tcof1, Treacle protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcof1O08784 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tcof1O08784 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tcof1O08784 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tcof1O08784 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tcof1O08784 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Tcof1O08784 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tcof1O08784 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tcof1O08784 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tcof1O08784 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tcof1O08784 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tcof1O08784 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tcof1O08784 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tcof1O08784 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tcof1O08784 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tcof1O08784 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tcof1O08784 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tcof1O08784 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tcof1O08784 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tcof1O08784 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tcof1O08784 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tcof1O08784 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tcof1O08784 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tcof1O08784 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tcof1O08784 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tcof1O08784 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Tcof1O08784 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tcof1O08784 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tcof1O08784 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tcof1O08784 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tcof1O08784 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tcof1O08784 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tcof1O08784 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tcof1O08784 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Tcof1O08784 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Tcof1O08784 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tcof1O08784 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tcof1O08784 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tcof1O08784 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tcof1O08784 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tcof1O08784 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tcof1O08784 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tcof1O08784 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tcof1O08784 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Tcof1O08784 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tcof1O08784 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tcof1O08784 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tcof1O08784 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tcof1O08784 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tcof1O08784 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Tcof1O08784 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Tcof1O08784 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tcof1O08784 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tcof1O08784 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tcof1O08784 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tcof1O08784 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tcof1O08784 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tcof1O08784 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tcof1O08784 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tcof1O08784 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Tcof1O08784 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tcof1O08784 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tcof1O08784 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tcof1O08784 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tcof1O08784 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tcof1O08784 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tcof1O08784 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tcof1O08784 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tcof1O08784 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Tcof1O08784 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tcof1O08784 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tcof1O08784 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tcof1O08784 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tcof1O08784 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tcof1O08784 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Tcof1O08784 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tcof1O08784 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tcof1O08784 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tcof1O08784 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tcof1O08784 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tcof1O08784 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Tcof1O08784 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tcof1O08784 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tcof1O08784 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tcof1O08784 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tcof1O08784 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tcof1O08784 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Tcof1O08784 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tcof1O08784 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tcof1O08784 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tcof1O08784 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tcof1O08784 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tcof1O08784 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tcof1O08784 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tcof1O08784 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tcof1O08784 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tcof1O08784 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tcof1O08784 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Tcof1O08784 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tcof1O08784 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tcof1O08784 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms