Protein–RNA interactions for Protein: O08688

Capn5, Calpain-5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn5O08688 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn5O08688 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn5O08688 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn5O08688 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn5O08688 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn5O08688 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn5O08688 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn5O08688 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn5O08688 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn5O08688 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn5O08688 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn5O08688 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn5O08688 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capn5O08688 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Capn5O08688 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capn5O08688 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capn5O08688 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn5O08688 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn5O08688 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn5O08688 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn5O08688 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn5O08688 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn5O08688 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn5O08688 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn5O08688 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn5O08688 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn5O08688 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn5O08688 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn5O08688 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn5O08688 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn5O08688 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn5O08688 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn5O08688 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn5O08688 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn5O08688 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn5O08688 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Capn5O08688 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Capn5O08688 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn5O08688 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn5O08688 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn5O08688 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Capn5O08688 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Capn5O08688 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Capn5O08688 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Capn5O08688 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Capn5O08688 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Capn5O08688 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capn5O08688 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capn5O08688 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capn5O08688 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capn5O08688 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capn5O08688 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capn5O08688 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capn5O08688 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capn5O08688 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Capn5O08688 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Capn5O08688 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Capn5O08688 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Capn5O08688 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Capn5O08688 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Capn5O08688 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Capn5O08688 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn5O08688 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn5O08688 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn5O08688 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn5O08688 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn5O08688 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn5O08688 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn5O08688 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn5O08688 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn5O08688 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn5O08688 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn5O08688 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn5O08688 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn5O08688 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn5O08688 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn5O08688 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn5O08688 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capn5O08688 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capn5O08688 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Capn5O08688 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capn5O08688 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn5O08688 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn5O08688 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn5O08688 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn5O08688 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Capn5O08688 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Capn5O08688 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Capn5O08688 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Capn5O08688 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Capn5O08688 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Capn5O08688 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Capn5O08688 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capn5O08688 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capn5O08688 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capn5O08688 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capn5O08688 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capn5O08688 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capn5O08688 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capn5O08688 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms