Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema3aO08665 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema3aO08665 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema3aO08665 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema3aO08665 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema3aO08665 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema3aO08665 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema3aO08665 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema3aO08665 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema3aO08665 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema3aO08665 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema3aO08665 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema3aO08665 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema3aO08665 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema3aO08665 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema3aO08665 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema3aO08665 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema3aO08665 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema3aO08665 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema3aO08665 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema3aO08665 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema3aO08665 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema3aO08665 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema3aO08665 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema3aO08665 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema3aO08665 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema3aO08665 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema3aO08665 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema3aO08665 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema3aO08665 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema3aO08665 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema3aO08665 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema3aO08665 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema3aO08665 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema3aO08665 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema3aO08665 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema3aO08665 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema3aO08665 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema3aO08665 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema3aO08665 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema3aO08665 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema3aO08665 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema3aO08665 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema3aO08665 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema3aO08665 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema3aO08665 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sema3aO08665 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema3aO08665 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema3aO08665 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema3aO08665 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema3aO08665 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema3aO08665 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema3aO08665 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema3aO08665 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema3aO08665 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema3aO08665 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema3aO08665 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema3aO08665 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema3aO08665 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema3aO08665 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema3aO08665 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema3aO08665 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema3aO08665 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema3aO08665 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema3aO08665 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema3aO08665 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema3aO08665 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema3aO08665 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema3aO08665 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema3aO08665 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema3aO08665 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema3aO08665 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema3aO08665 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema3aO08665 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema3aO08665 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema3aO08665 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema3aO08665 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema3aO08665 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema3aO08665 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema3aO08665 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema3aO08665 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema3aO08665 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema3aO08665 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema3aO08665 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema3aO08665 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema3aO08665 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema3aO08665 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema3aO08665 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema3aO08665 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema3aO08665 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema3aO08665 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema3aO08665 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema3aO08665 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema3aO08665 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema3aO08665 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema3aO08665 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Sema3aO08665 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema3aO08665 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema3aO08665 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema3aO08665 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.9 ms