Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ascl4M0QW46 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ascl4M0QW46 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ascl4M0QW46 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ascl4M0QW46 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ascl4M0QW46 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ascl4M0QW46 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ascl4M0QW46 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ascl4M0QW46 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ascl4M0QW46 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ascl4M0QW46 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ascl4M0QW46 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ascl4M0QW46 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ascl4M0QW46 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ascl4M0QW46 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ascl4M0QW46 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ascl4M0QW46 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ascl4M0QW46 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ascl4M0QW46 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ascl4M0QW46 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ascl4M0QW46 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ascl4M0QW46 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ascl4M0QW46 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ascl4M0QW46 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ascl4M0QW46 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ascl4M0QW46 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ascl4M0QW46 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ascl4M0QW46 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ascl4M0QW46 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ascl4M0QW46 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ascl4M0QW46 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ascl4M0QW46 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ascl4M0QW46 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ascl4M0QW46 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ascl4M0QW46 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ascl4M0QW46 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ascl4M0QW46 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ascl4M0QW46 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ascl4M0QW46 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ascl4M0QW46 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ascl4M0QW46 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ascl4M0QW46 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ascl4M0QW46 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ascl4M0QW46 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ascl4M0QW46 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ascl4M0QW46 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ascl4M0QW46 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ascl4M0QW46 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ascl4M0QW46 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ascl4M0QW46 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ascl4M0QW46 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ascl4M0QW46 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ascl4M0QW46 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ascl4M0QW46 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ascl4M0QW46 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms