Protein–RNA interactions for Protein: L7N285

Gm3115, Predicted gene 3115, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3115L7N285 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3115L7N285 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3115L7N285 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3115L7N285 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3115L7N285 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3115L7N285 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3115L7N285 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3115L7N285 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3115L7N285 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3115L7N285 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3115L7N285 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3115L7N285 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3115L7N285 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3115L7N285 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3115L7N285 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3115L7N285 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3115L7N285 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3115L7N285 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3115L7N285 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3115L7N285 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3115L7N285 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3115L7N285 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3115L7N285 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3115L7N285 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm3115L7N285 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm3115L7N285 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm3115L7N285 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3115L7N285 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3115L7N285 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3115L7N285 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3115L7N285 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3115L7N285 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3115L7N285 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3115L7N285 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3115L7N285 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3115L7N285 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3115L7N285 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3115L7N285 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3115L7N285 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3115L7N285 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3115L7N285 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3115L7N285 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3115L7N285 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3115L7N285 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3115L7N285 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3115L7N285 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3115L7N285 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3115L7N285 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3115L7N285 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3115L7N285 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3115L7N285 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3115L7N285 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3115L7N285 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3115L7N285 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3115L7N285 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3115L7N285 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3115L7N285 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3115L7N285 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3115L7N285 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3115L7N285 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3115L7N285 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3115L7N285 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3115L7N285 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3115L7N285 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3115L7N285 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm3115L7N285 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm3115L7N285 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3115L7N285 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3115L7N285 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3115L7N285 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3115L7N285 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gm3115L7N285 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3115L7N285 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3115L7N285 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3115L7N285 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3115L7N285 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3115L7N285 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3115L7N285 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3115L7N285 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3115L7N285 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3115L7N285 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3115L7N285 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3115L7N285 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3115L7N285 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3115L7N285 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3115L7N285 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3115L7N285 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3115L7N285 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3115L7N285 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3115L7N285 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm3115L7N285 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3115L7N285 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3115L7N285 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3115L7N285 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3115L7N285 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3115L7N285 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3115L7N285 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3115L7N285 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3115L7N285 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3115L7N285 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms