Protein–RNA interactions for Protein: K7N6T7

Gm2897, Predicted gene 2897, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2897K7N6T7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm2897K7N6T7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm2897K7N6T7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm2897K7N6T7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm2897K7N6T7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm2897K7N6T7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm2897K7N6T7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm2897K7N6T7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm2897K7N6T7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm2897K7N6T7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm2897K7N6T7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm2897K7N6T7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm2897K7N6T7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm2897K7N6T7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm2897K7N6T7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm2897K7N6T7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm2897K7N6T7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm2897K7N6T7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm2897K7N6T7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm2897K7N6T7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm2897K7N6T7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm2897K7N6T7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm2897K7N6T7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm2897K7N6T7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm2897K7N6T7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm2897K7N6T7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm2897K7N6T7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm2897K7N6T7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm2897K7N6T7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm2897K7N6T7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm2897K7N6T7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm2897K7N6T7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm2897K7N6T7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm2897K7N6T7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm2897K7N6T7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm2897K7N6T7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm2897K7N6T7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm2897K7N6T7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm2897K7N6T7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm2897K7N6T7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm2897K7N6T7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm2897K7N6T7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm2897K7N6T7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm2897K7N6T7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm2897K7N6T7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm2897K7N6T7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm2897K7N6T7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm2897K7N6T7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm2897K7N6T7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm2897K7N6T7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm2897K7N6T7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm2897K7N6T7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm2897K7N6T7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm2897K7N6T7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm2897K7N6T7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm2897K7N6T7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm2897K7N6T7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm2897K7N6T7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm2897K7N6T7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm2897K7N6T7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm2897K7N6T7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm2897K7N6T7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm2897K7N6T7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm2897K7N6T7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm2897K7N6T7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm2897K7N6T7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm2897K7N6T7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm2897K7N6T7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm2897K7N6T7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm2897K7N6T7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm2897K7N6T7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm2897K7N6T7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm2897K7N6T7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm2897K7N6T7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm2897K7N6T7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm2897K7N6T7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm2897K7N6T7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm2897K7N6T7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm2897K7N6T7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm2897K7N6T7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm2897K7N6T7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm2897K7N6T7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm2897K7N6T7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm2897K7N6T7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm2897K7N6T7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm2897K7N6T7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm2897K7N6T7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm2897K7N6T7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm2897K7N6T7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm2897K7N6T7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm2897K7N6T7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm2897K7N6T7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm2897K7N6T7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm2897K7N6T7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm2897K7N6T7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm2897K7N6T7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm2897K7N6T7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm2897K7N6T7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm2897K7N6T7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm2897K7N6T7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms