Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP8

Alkal1, ALK and LTK ligand 1, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkal1J3QPP8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Alkal1J3QPP8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Alkal1J3QPP8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Alkal1J3QPP8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alkal1J3QPP8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Alkal1J3QPP8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Alkal1J3QPP8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Alkal1J3QPP8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Alkal1J3QPP8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alkal1J3QPP8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alkal1J3QPP8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alkal1J3QPP8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Alkal1J3QPP8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Alkal1J3QPP8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Alkal1J3QPP8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Alkal1J3QPP8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Alkal1J3QPP8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Alkal1J3QPP8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Alkal1J3QPP8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Alkal1J3QPP8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Alkal1J3QPP8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Alkal1J3QPP8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Alkal1J3QPP8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Alkal1J3QPP8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Alkal1J3QPP8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Alkal1J3QPP8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Alkal1J3QPP8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alkal1J3QPP8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Alkal1J3QPP8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alkal1J3QPP8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alkal1J3QPP8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alkal1J3QPP8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alkal1J3QPP8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alkal1J3QPP8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alkal1J3QPP8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alkal1J3QPP8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alkal1J3QPP8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alkal1J3QPP8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alkal1J3QPP8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alkal1J3QPP8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Alkal1J3QPP8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alkal1J3QPP8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alkal1J3QPP8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alkal1J3QPP8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alkal1J3QPP8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alkal1J3QPP8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Alkal1J3QPP8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Alkal1J3QPP8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Alkal1J3QPP8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Alkal1J3QPP8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Alkal1J3QPP8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Alkal1J3QPP8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Alkal1J3QPP8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Alkal1J3QPP8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Alkal1J3QPP8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Alkal1J3QPP8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Alkal1J3QPP8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Alkal1J3QPP8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Alkal1J3QPP8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Alkal1J3QPP8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Alkal1J3QPP8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Alkal1J3QPP8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Alkal1J3QPP8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alkal1J3QPP8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alkal1J3QPP8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Alkal1J3QPP8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Alkal1J3QPP8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Alkal1J3QPP8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Alkal1J3QPP8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Alkal1J3QPP8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Alkal1J3QPP8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Alkal1J3QPP8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Alkal1J3QPP8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Alkal1J3QPP8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Alkal1J3QPP8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Alkal1J3QPP8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Alkal1J3QPP8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alkal1J3QPP8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alkal1J3QPP8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alkal1J3QPP8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alkal1J3QPP8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alkal1J3QPP8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Alkal1J3QPP8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Alkal1J3QPP8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Alkal1J3QPP8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Alkal1J3QPP8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Alkal1J3QPP8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Alkal1J3QPP8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Alkal1J3QPP8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Alkal1J3QPP8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Alkal1J3QPP8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Alkal1J3QPP8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Alkal1J3QPP8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Alkal1J3QPP8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Alkal1J3QPP8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Alkal1J3QPP8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Alkal1J3QPP8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Alkal1J3QPP8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Alkal1J3QPP8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Alkal1J3QPP8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.4 ms