Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20830J3KML6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20830J3KML6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20830J3KML6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20830J3KML6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20830J3KML6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20830J3KML6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20830J3KML6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20830J3KML6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20830J3KML6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20830J3KML6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20830J3KML6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20830J3KML6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20830J3KML6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20830J3KML6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20830J3KML6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20830J3KML6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20830J3KML6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20830J3KML6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20830J3KML6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20830J3KML6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20830J3KML6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20830J3KML6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20830J3KML6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20830J3KML6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20830J3KML6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20830J3KML6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20830J3KML6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20830J3KML6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20830J3KML6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20830J3KML6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20830J3KML6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20830J3KML6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20830J3KML6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20830J3KML6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20830J3KML6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20830J3KML6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20830J3KML6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20830J3KML6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20830J3KML6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20830J3KML6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20830J3KML6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20830J3KML6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20830J3KML6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20830J3KML6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20830J3KML6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20830J3KML6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20830J3KML6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20830J3KML6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20830J3KML6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20830J3KML6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20830J3KML6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20830J3KML6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20830J3KML6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20830J3KML6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20830J3KML6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20830J3KML6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20830J3KML6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20830J3KML6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20830J3KML6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20830J3KML6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20830J3KML6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20830J3KML6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20830J3KML6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20830J3KML6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20830J3KML6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20830J3KML6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20830J3KML6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20830J3KML6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20830J3KML6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20830J3KML6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20830J3KML6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20830J3KML6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20830J3KML6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20830J3KML6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20830J3KML6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20830J3KML6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20830J3KML6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20830J3KML6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20830J3KML6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20830J3KML6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20830J3KML6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20830J3KML6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20830J3KML6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20830J3KML6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20830J3KML6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20830J3KML6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20830J3KML6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20830J3KML6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20830J3KML6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20830J3KML6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20830J3KML6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20830J3KML6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm20830J3KML6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20830J3KML6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20830J3KML6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20830J3KML6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20830J3KML6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20830J3KML6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20830J3KML6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms