Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G4

Vmn2r19, MCG130583, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r19G5E8G4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vmn2r19G5E8G4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vmn2r19G5E8G4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vmn2r19G5E8G4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vmn2r19G5E8G4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Vmn2r19G5E8G4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Vmn2r19G5E8G4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vmn2r19G5E8G4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Vmn2r19G5E8G4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Vmn2r19G5E8G4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vmn2r19G5E8G4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vmn2r19G5E8G4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vmn2r19G5E8G4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vmn2r19G5E8G4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vmn2r19G5E8G4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vmn2r19G5E8G4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vmn2r19G5E8G4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vmn2r19G5E8G4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vmn2r19G5E8G4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vmn2r19G5E8G4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vmn2r19G5E8G4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vmn2r19G5E8G4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vmn2r19G5E8G4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vmn2r19G5E8G4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vmn2r19G5E8G4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vmn2r19G5E8G4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Vmn2r19G5E8G4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vmn2r19G5E8G4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vmn2r19G5E8G4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vmn2r19G5E8G4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vmn2r19G5E8G4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vmn2r19G5E8G4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vmn2r19G5E8G4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vmn2r19G5E8G4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vmn2r19G5E8G4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vmn2r19G5E8G4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vmn2r19G5E8G4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vmn2r19G5E8G4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vmn2r19G5E8G4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Vmn2r19G5E8G4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vmn2r19G5E8G4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vmn2r19G5E8G4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vmn2r19G5E8G4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vmn2r19G5E8G4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vmn2r19G5E8G4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vmn2r19G5E8G4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vmn2r19G5E8G4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vmn2r19G5E8G4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vmn2r19G5E8G4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vmn2r19G5E8G4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vmn2r19G5E8G4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vmn2r19G5E8G4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vmn2r19G5E8G4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vmn2r19G5E8G4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vmn2r19G5E8G4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vmn2r19G5E8G4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Vmn2r19G5E8G4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vmn2r19G5E8G4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vmn2r19G5E8G4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vmn2r19G5E8G4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vmn2r19G5E8G4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vmn2r19G5E8G4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vmn2r19G5E8G4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vmn2r19G5E8G4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vmn2r19G5E8G4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vmn2r19G5E8G4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vmn2r19G5E8G4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vmn2r19G5E8G4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vmn2r19G5E8G4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vmn2r19G5E8G4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vmn2r19G5E8G4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn2r19G5E8G4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn2r19G5E8G4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn2r19G5E8G4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn2r19G5E8G4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn2r19G5E8G4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn2r19G5E8G4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn2r19G5E8G4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vmn2r19G5E8G4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Vmn2r19G5E8G4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Vmn2r19G5E8G4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vmn2r19G5E8G4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vmn2r19G5E8G4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vmn2r19G5E8G4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vmn2r19G5E8G4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Vmn2r19G5E8G4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vmn2r19G5E8G4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vmn2r19G5E8G4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vmn2r19G5E8G4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vmn2r19G5E8G4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vmn2r19G5E8G4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn2r19G5E8G4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn2r19G5E8G4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Vmn2r19G5E8G4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vmn2r19G5E8G4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vmn2r19G5E8G4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn2r19G5E8G4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn2r19G5E8G4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn2r19G5E8G4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn2r19G5E8G4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms