Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf148G3X9R7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf148G3X9R7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf148G3X9R7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf148G3X9R7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf148G3X9R7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf148G3X9R7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf148G3X9R7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf148G3X9R7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf148G3X9R7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf148G3X9R7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf148G3X9R7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf148G3X9R7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf148G3X9R7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf148G3X9R7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf148G3X9R7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf148G3X9R7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf148G3X9R7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf148G3X9R7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf148G3X9R7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf148G3X9R7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf148G3X9R7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf148G3X9R7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf148G3X9R7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf148G3X9R7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf148G3X9R7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf148G3X9R7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf148G3X9R7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf148G3X9R7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf148G3X9R7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf148G3X9R7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf148G3X9R7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf148G3X9R7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf148G3X9R7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf148G3X9R7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf148G3X9R7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf148G3X9R7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf148G3X9R7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf148G3X9R7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf148G3X9R7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf148G3X9R7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf148G3X9R7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf148G3X9R7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf148G3X9R7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf148G3X9R7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf148G3X9R7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf148G3X9R7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf148G3X9R7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf148G3X9R7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf148G3X9R7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf148G3X9R7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf148G3X9R7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf148G3X9R7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf148G3X9R7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf148G3X9R7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf148G3X9R7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf148G3X9R7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf148G3X9R7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf148G3X9R7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf148G3X9R7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf148G3X9R7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf148G3X9R7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf148G3X9R7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf148G3X9R7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf148G3X9R7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf148G3X9R7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf148G3X9R7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf148G3X9R7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf148G3X9R7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf148G3X9R7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf148G3X9R7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf148G3X9R7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf148G3X9R7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf148G3X9R7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf148G3X9R7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf148G3X9R7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf148G3X9R7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf148G3X9R7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf148G3X9R7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf148G3X9R7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf148G3X9R7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf148G3X9R7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf148G3X9R7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf148G3X9R7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf148G3X9R7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf148G3X9R7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf148G3X9R7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf148G3X9R7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf148G3X9R7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf148G3X9R7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf148G3X9R7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf148G3X9R7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf148G3X9R7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf148G3X9R7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf148G3X9R7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf148G3X9R7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf148G3X9R7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf148G3X9R7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf148G3X9R7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf148G3X9R7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms