Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim55G3X8Y1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim55G3X8Y1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim55G3X8Y1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim55G3X8Y1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim55G3X8Y1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim55G3X8Y1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim55G3X8Y1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim55G3X8Y1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim55G3X8Y1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim55G3X8Y1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim55G3X8Y1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim55G3X8Y1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim55G3X8Y1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim55G3X8Y1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim55G3X8Y1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim55G3X8Y1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim55G3X8Y1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim55G3X8Y1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim55G3X8Y1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim55G3X8Y1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim55G3X8Y1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim55G3X8Y1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim55G3X8Y1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim55G3X8Y1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim55G3X8Y1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim55G3X8Y1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim55G3X8Y1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim55G3X8Y1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim55G3X8Y1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim55G3X8Y1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim55G3X8Y1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim55G3X8Y1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim55G3X8Y1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim55G3X8Y1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim55G3X8Y1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim55G3X8Y1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim55G3X8Y1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim55G3X8Y1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim55G3X8Y1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim55G3X8Y1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim55G3X8Y1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim55G3X8Y1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim55G3X8Y1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim55G3X8Y1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim55G3X8Y1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim55G3X8Y1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim55G3X8Y1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim55G3X8Y1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim55G3X8Y1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim55G3X8Y1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim55G3X8Y1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim55G3X8Y1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim55G3X8Y1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim55G3X8Y1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim55G3X8Y1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim55G3X8Y1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim55G3X8Y1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim55G3X8Y1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim55G3X8Y1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim55G3X8Y1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim55G3X8Y1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim55G3X8Y1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim55G3X8Y1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim55G3X8Y1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim55G3X8Y1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim55G3X8Y1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim55G3X8Y1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim55G3X8Y1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim55G3X8Y1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim55G3X8Y1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim55G3X8Y1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim55G3X8Y1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim55G3X8Y1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim55G3X8Y1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim55G3X8Y1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim55G3X8Y1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim55G3X8Y1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim55G3X8Y1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim55G3X8Y1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim55G3X8Y1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim55G3X8Y1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim55G3X8Y1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim55G3X8Y1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim55G3X8Y1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim55G3X8Y1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim55G3X8Y1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim55G3X8Y1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim55G3X8Y1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim55G3X8Y1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim55G3X8Y1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim55G3X8Y1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim55G3X8Y1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim55G3X8Y1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Trim55G3X8Y1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim55G3X8Y1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim55G3X8Y1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim55G3X8Y1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim55G3X8Y1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim55G3X8Y1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms