Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srp72F8VQC1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srp72F8VQC1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srp72F8VQC1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srp72F8VQC1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srp72F8VQC1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srp72F8VQC1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srp72F8VQC1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srp72F8VQC1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srp72F8VQC1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srp72F8VQC1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srp72F8VQC1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srp72F8VQC1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srp72F8VQC1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srp72F8VQC1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srp72F8VQC1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srp72F8VQC1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srp72F8VQC1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srp72F8VQC1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srp72F8VQC1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srp72F8VQC1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srp72F8VQC1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srp72F8VQC1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srp72F8VQC1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Srp72F8VQC1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Srp72F8VQC1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srp72F8VQC1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Srp72F8VQC1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srp72F8VQC1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srp72F8VQC1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srp72F8VQC1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srp72F8VQC1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srp72F8VQC1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srp72F8VQC1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srp72F8VQC1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srp72F8VQC1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srp72F8VQC1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srp72F8VQC1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srp72F8VQC1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srp72F8VQC1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srp72F8VQC1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srp72F8VQC1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srp72F8VQC1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Srp72F8VQC1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srp72F8VQC1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srp72F8VQC1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srp72F8VQC1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Srp72F8VQC1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srp72F8VQC1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srp72F8VQC1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srp72F8VQC1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srp72F8VQC1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srp72F8VQC1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srp72F8VQC1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srp72F8VQC1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srp72F8VQC1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srp72F8VQC1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srp72F8VQC1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srp72F8VQC1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Srp72F8VQC1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srp72F8VQC1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srp72F8VQC1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srp72F8VQC1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srp72F8VQC1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srp72F8VQC1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srp72F8VQC1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srp72F8VQC1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srp72F8VQC1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srp72F8VQC1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srp72F8VQC1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srp72F8VQC1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srp72F8VQC1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srp72F8VQC1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Srp72F8VQC1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srp72F8VQC1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srp72F8VQC1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srp72F8VQC1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srp72F8VQC1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srp72F8VQC1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srp72F8VQC1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srp72F8VQC1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srp72F8VQC1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srp72F8VQC1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srp72F8VQC1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srp72F8VQC1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srp72F8VQC1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srp72F8VQC1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srp72F8VQC1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Srp72F8VQC1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srp72F8VQC1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srp72F8VQC1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srp72F8VQC1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srp72F8VQC1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srp72F8VQC1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srp72F8VQC1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srp72F8VQC1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srp72F8VQC1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srp72F8VQC1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srp72F8VQC1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srp72F8VQC1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms