Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NpcdF8VQB8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NpcdF8VQB8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NpcdF8VQB8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NpcdF8VQB8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NpcdF8VQB8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NpcdF8VQB8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NpcdF8VQB8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NpcdF8VQB8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NpcdF8VQB8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
NpcdF8VQB8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NpcdF8VQB8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NpcdF8VQB8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NpcdF8VQB8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NpcdF8VQB8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NpcdF8VQB8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NpcdF8VQB8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NpcdF8VQB8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NpcdF8VQB8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NpcdF8VQB8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NpcdF8VQB8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NpcdF8VQB8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NpcdF8VQB8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NpcdF8VQB8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NpcdF8VQB8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NpcdF8VQB8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NpcdF8VQB8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NpcdF8VQB8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NpcdF8VQB8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NpcdF8VQB8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NpcdF8VQB8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NpcdF8VQB8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NpcdF8VQB8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NpcdF8VQB8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NpcdF8VQB8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NpcdF8VQB8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NpcdF8VQB8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NpcdF8VQB8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NpcdF8VQB8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NpcdF8VQB8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NpcdF8VQB8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NpcdF8VQB8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NpcdF8VQB8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NpcdF8VQB8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NpcdF8VQB8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NpcdF8VQB8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NpcdF8VQB8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NpcdF8VQB8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NpcdF8VQB8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NpcdF8VQB8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NpcdF8VQB8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NpcdF8VQB8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NpcdF8VQB8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NpcdF8VQB8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NpcdF8VQB8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NpcdF8VQB8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NpcdF8VQB8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NpcdF8VQB8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NpcdF8VQB8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NpcdF8VQB8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NpcdF8VQB8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NpcdF8VQB8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NpcdF8VQB8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NpcdF8VQB8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NpcdF8VQB8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NpcdF8VQB8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NpcdF8VQB8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NpcdF8VQB8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NpcdF8VQB8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NpcdF8VQB8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NpcdF8VQB8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NpcdF8VQB8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NpcdF8VQB8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NpcdF8VQB8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NpcdF8VQB8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NpcdF8VQB8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NpcdF8VQB8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NpcdF8VQB8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NpcdF8VQB8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NpcdF8VQB8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NpcdF8VQB8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NpcdF8VQB8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NpcdF8VQB8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NpcdF8VQB8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NpcdF8VQB8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NpcdF8VQB8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NpcdF8VQB8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NpcdF8VQB8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NpcdF8VQB8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NpcdF8VQB8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NpcdF8VQB8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NpcdF8VQB8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NpcdF8VQB8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NpcdF8VQB8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NpcdF8VQB8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NpcdF8VQB8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NpcdF8VQB8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NpcdF8VQB8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NpcdF8VQB8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NpcdF8VQB8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms