Protein–RNA interactions for Protein: F6WEU2

Ccdc188, Coiled-coil domain-containing 188, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc188F6WEU2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc188F6WEU2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc188F6WEU2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc188F6WEU2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc188F6WEU2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc188F6WEU2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc188F6WEU2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc188F6WEU2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc188F6WEU2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc188F6WEU2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc188F6WEU2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc188F6WEU2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc188F6WEU2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc188F6WEU2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc188F6WEU2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc188F6WEU2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc188F6WEU2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc188F6WEU2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc188F6WEU2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc188F6WEU2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc188F6WEU2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc188F6WEU2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc188F6WEU2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc188F6WEU2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc188F6WEU2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc188F6WEU2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc188F6WEU2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc188F6WEU2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc188F6WEU2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc188F6WEU2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc188F6WEU2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc188F6WEU2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc188F6WEU2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc188F6WEU2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc188F6WEU2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc188F6WEU2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc188F6WEU2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc188F6WEU2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc188F6WEU2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc188F6WEU2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc188F6WEU2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc188F6WEU2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc188F6WEU2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc188F6WEU2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc188F6WEU2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc188F6WEU2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc188F6WEU2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc188F6WEU2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc188F6WEU2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc188F6WEU2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc188F6WEU2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc188F6WEU2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc188F6WEU2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc188F6WEU2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc188F6WEU2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc188F6WEU2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc188F6WEU2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc188F6WEU2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc188F6WEU2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc188F6WEU2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc188F6WEU2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc188F6WEU2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc188F6WEU2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc188F6WEU2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc188F6WEU2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc188F6WEU2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc188F6WEU2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc188F6WEU2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc188F6WEU2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc188F6WEU2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc188F6WEU2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc188F6WEU2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc188F6WEU2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc188F6WEU2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc188F6WEU2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc188F6WEU2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc188F6WEU2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc188F6WEU2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc188F6WEU2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc188F6WEU2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc188F6WEU2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc188F6WEU2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc188F6WEU2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc188F6WEU2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc188F6WEU2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc188F6WEU2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc188F6WEU2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc188F6WEU2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc188F6WEU2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc188F6WEU2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc188F6WEU2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc188F6WEU2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc188F6WEU2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc188F6WEU2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc188F6WEU2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc188F6WEU2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc188F6WEU2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc188F6WEU2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc188F6WEU2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc188F6WEU2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms