Protein–RNA interactions for Protein: F6V035

Ccdc149, Coiled-coil domain-containing 149, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc149F6V035 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc149F6V035 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc149F6V035 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc149F6V035 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc149F6V035 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc149F6V035 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc149F6V035 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc149F6V035 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc149F6V035 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc149F6V035 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc149F6V035 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc149F6V035 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc149F6V035 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc149F6V035 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc149F6V035 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc149F6V035 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc149F6V035 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc149F6V035 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc149F6V035 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc149F6V035 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc149F6V035 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc149F6V035 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc149F6V035 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc149F6V035 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc149F6V035 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc149F6V035 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc149F6V035 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc149F6V035 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc149F6V035 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc149F6V035 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc149F6V035 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc149F6V035 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc149F6V035 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc149F6V035 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc149F6V035 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc149F6V035 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc149F6V035 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc149F6V035 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc149F6V035 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc149F6V035 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc149F6V035 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc149F6V035 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc149F6V035 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc149F6V035 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc149F6V035 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc149F6V035 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc149F6V035 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc149F6V035 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc149F6V035 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc149F6V035 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc149F6V035 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc149F6V035 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc149F6V035 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc149F6V035 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc149F6V035 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc149F6V035 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc149F6V035 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc149F6V035 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc149F6V035 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc149F6V035 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc149F6V035 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc149F6V035 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc149F6V035 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc149F6V035 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc149F6V035 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc149F6V035 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc149F6V035 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc149F6V035 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc149F6V035 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc149F6V035 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc149F6V035 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc149F6V035 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc149F6V035 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc149F6V035 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc149F6V035 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc149F6V035 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc149F6V035 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc149F6V035 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc149F6V035 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc149F6V035 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc149F6V035 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc149F6V035 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc149F6V035 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc149F6V035 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc149F6V035 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc149F6V035 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc149F6V035 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc149F6V035 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc149F6V035 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc149F6V035 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc149F6V035 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc149F6V035 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc149F6V035 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc149F6V035 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc149F6V035 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc149F6V035 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc149F6V035 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc149F6V035 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc149F6V035 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc149F6V035 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms