Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Raph1F2Z3U3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Raph1F2Z3U3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Raph1F2Z3U3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Raph1F2Z3U3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Raph1F2Z3U3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Raph1F2Z3U3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Raph1F2Z3U3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Raph1F2Z3U3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Raph1F2Z3U3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Raph1F2Z3U3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Raph1F2Z3U3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Raph1F2Z3U3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Raph1F2Z3U3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Raph1F2Z3U3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Raph1F2Z3U3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Raph1F2Z3U3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Raph1F2Z3U3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Raph1F2Z3U3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Raph1F2Z3U3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Raph1F2Z3U3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Raph1F2Z3U3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Raph1F2Z3U3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Raph1F2Z3U3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Raph1F2Z3U3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Raph1F2Z3U3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Raph1F2Z3U3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Raph1F2Z3U3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Raph1F2Z3U3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Raph1F2Z3U3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Raph1F2Z3U3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Raph1F2Z3U3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Raph1F2Z3U3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Raph1F2Z3U3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Raph1F2Z3U3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Raph1F2Z3U3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Raph1F2Z3U3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Raph1F2Z3U3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Raph1F2Z3U3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Raph1F2Z3U3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Raph1F2Z3U3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Raph1F2Z3U3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Raph1F2Z3U3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Raph1F2Z3U3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Raph1F2Z3U3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Raph1F2Z3U3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Raph1F2Z3U3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Raph1F2Z3U3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Raph1F2Z3U3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Raph1F2Z3U3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Raph1F2Z3U3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Raph1F2Z3U3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Raph1F2Z3U3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Raph1F2Z3U3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Raph1F2Z3U3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Raph1F2Z3U3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Raph1F2Z3U3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Raph1F2Z3U3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Raph1F2Z3U3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Raph1F2Z3U3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Raph1F2Z3U3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Raph1F2Z3U3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Raph1F2Z3U3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Raph1F2Z3U3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Raph1F2Z3U3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Raph1F2Z3U3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Raph1F2Z3U3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Raph1F2Z3U3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Raph1F2Z3U3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Raph1F2Z3U3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Raph1F2Z3U3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Raph1F2Z3U3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Raph1F2Z3U3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Raph1F2Z3U3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Raph1F2Z3U3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Raph1F2Z3U3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Raph1F2Z3U3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Raph1F2Z3U3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Raph1F2Z3U3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Raph1F2Z3U3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Raph1F2Z3U3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Raph1F2Z3U3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Raph1F2Z3U3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Raph1F2Z3U3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Raph1F2Z3U3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Raph1F2Z3U3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Raph1F2Z3U3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Raph1F2Z3U3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Raph1F2Z3U3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Raph1F2Z3U3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Raph1F2Z3U3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Raph1F2Z3U3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Raph1F2Z3U3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Raph1F2Z3U3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Raph1F2Z3U3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Raph1F2Z3U3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Raph1F2Z3U3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Raph1F2Z3U3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Raph1F2Z3U3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Raph1F2Z3U3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms