Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf165E9QAU8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf165E9QAU8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf165E9QAU8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf165E9QAU8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf165E9QAU8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf165E9QAU8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf165E9QAU8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf165E9QAU8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf165E9QAU8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf165E9QAU8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf165E9QAU8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf165E9QAU8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf165E9QAU8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf165E9QAU8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf165E9QAU8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf165E9QAU8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf165E9QAU8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf165E9QAU8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf165E9QAU8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf165E9QAU8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf165E9QAU8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf165E9QAU8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf165E9QAU8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf165E9QAU8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf165E9QAU8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf165E9QAU8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf165E9QAU8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Rnf165E9QAU8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf165E9QAU8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf165E9QAU8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf165E9QAU8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf165E9QAU8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf165E9QAU8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf165E9QAU8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf165E9QAU8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf165E9QAU8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf165E9QAU8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf165E9QAU8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf165E9QAU8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf165E9QAU8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf165E9QAU8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf165E9QAU8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf165E9QAU8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf165E9QAU8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf165E9QAU8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rnf165E9QAU8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rnf165E9QAU8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rnf165E9QAU8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf165E9QAU8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf165E9QAU8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf165E9QAU8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf165E9QAU8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf165E9QAU8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf165E9QAU8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf165E9QAU8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf165E9QAU8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf165E9QAU8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf165E9QAU8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf165E9QAU8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf165E9QAU8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf165E9QAU8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf165E9QAU8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf165E9QAU8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf165E9QAU8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf165E9QAU8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf165E9QAU8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf165E9QAU8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf165E9QAU8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf165E9QAU8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf165E9QAU8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf165E9QAU8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf165E9QAU8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf165E9QAU8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf165E9QAU8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf165E9QAU8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf165E9QAU8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf165E9QAU8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf165E9QAU8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf165E9QAU8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf165E9QAU8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf165E9QAU8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf165E9QAU8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf165E9QAU8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf165E9QAU8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf165E9QAU8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf165E9QAU8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf165E9QAU8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf165E9QAU8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf165E9QAU8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf165E9QAU8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf165E9QAU8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf165E9QAU8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf165E9QAU8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf165E9QAU8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf165E9QAU8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf165E9QAU8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf165E9QAU8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf165E9QAU8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf165E9QAU8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms