Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
R3hdm1E9Q9Q2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
R3hdm1E9Q9Q2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
R3hdm1E9Q9Q2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
R3hdm1E9Q9Q2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
R3hdm1E9Q9Q2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
R3hdm1E9Q9Q2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
R3hdm1E9Q9Q2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
R3hdm1E9Q9Q2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
R3hdm1E9Q9Q2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
R3hdm1E9Q9Q2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
R3hdm1E9Q9Q2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
R3hdm1E9Q9Q2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
R3hdm1E9Q9Q2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
R3hdm1E9Q9Q2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
R3hdm1E9Q9Q2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
R3hdm1E9Q9Q2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
R3hdm1E9Q9Q2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
R3hdm1E9Q9Q2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
R3hdm1E9Q9Q2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
R3hdm1E9Q9Q2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
R3hdm1E9Q9Q2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
R3hdm1E9Q9Q2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
R3hdm1E9Q9Q2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
R3hdm1E9Q9Q2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
R3hdm1E9Q9Q2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
R3hdm1E9Q9Q2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
R3hdm1E9Q9Q2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
R3hdm1E9Q9Q2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
R3hdm1E9Q9Q2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
R3hdm1E9Q9Q2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
R3hdm1E9Q9Q2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
R3hdm1E9Q9Q2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
R3hdm1E9Q9Q2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
R3hdm1E9Q9Q2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
R3hdm1E9Q9Q2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
R3hdm1E9Q9Q2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
R3hdm1E9Q9Q2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
R3hdm1E9Q9Q2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
R3hdm1E9Q9Q2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
R3hdm1E9Q9Q2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
R3hdm1E9Q9Q2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
R3hdm1E9Q9Q2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
R3hdm1E9Q9Q2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
R3hdm1E9Q9Q2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
R3hdm1E9Q9Q2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
R3hdm1E9Q9Q2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
R3hdm1E9Q9Q2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
R3hdm1E9Q9Q2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
R3hdm1E9Q9Q2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
R3hdm1E9Q9Q2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
R3hdm1E9Q9Q2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
R3hdm1E9Q9Q2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
R3hdm1E9Q9Q2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
R3hdm1E9Q9Q2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
R3hdm1E9Q9Q2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
R3hdm1E9Q9Q2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
R3hdm1E9Q9Q2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
R3hdm1E9Q9Q2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
R3hdm1E9Q9Q2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
R3hdm1E9Q9Q2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
R3hdm1E9Q9Q2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
R3hdm1E9Q9Q2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
R3hdm1E9Q9Q2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
R3hdm1E9Q9Q2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
R3hdm1E9Q9Q2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
R3hdm1E9Q9Q2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
R3hdm1E9Q9Q2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
R3hdm1E9Q9Q2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
R3hdm1E9Q9Q2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
R3hdm1E9Q9Q2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
R3hdm1E9Q9Q2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
R3hdm1E9Q9Q2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
R3hdm1E9Q9Q2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
R3hdm1E9Q9Q2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
R3hdm1E9Q9Q2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
R3hdm1E9Q9Q2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
R3hdm1E9Q9Q2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
R3hdm1E9Q9Q2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
R3hdm1E9Q9Q2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
R3hdm1E9Q9Q2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
R3hdm1E9Q9Q2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
R3hdm1E9Q9Q2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
R3hdm1E9Q9Q2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
R3hdm1E9Q9Q2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
R3hdm1E9Q9Q2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
R3hdm1E9Q9Q2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
R3hdm1E9Q9Q2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
R3hdm1E9Q9Q2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
R3hdm1E9Q9Q2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
R3hdm1E9Q9Q2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
R3hdm1E9Q9Q2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
R3hdm1E9Q9Q2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
R3hdm1E9Q9Q2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
R3hdm1E9Q9Q2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
R3hdm1E9Q9Q2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms