Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4S1

Pde8b, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, mousemouse

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Length 865 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde8bE9Q4S1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pde8bE9Q4S1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Pde8bE9Q4S1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Pde8bE9Q4S1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pde8bE9Q4S1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pde8bE9Q4S1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pde8bE9Q4S1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pde8bE9Q4S1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pde8bE9Q4S1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pde8bE9Q4S1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pde8bE9Q4S1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pde8bE9Q4S1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pde8bE9Q4S1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pde8bE9Q4S1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pde8bE9Q4S1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pde8bE9Q4S1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pde8bE9Q4S1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pde8bE9Q4S1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pde8bE9Q4S1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pde8bE9Q4S1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pde8bE9Q4S1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pde8bE9Q4S1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pde8bE9Q4S1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Pde8bE9Q4S1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pde8bE9Q4S1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pde8bE9Q4S1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pde8bE9Q4S1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Pde8bE9Q4S1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pde8bE9Q4S1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Pde8bE9Q4S1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Pde8bE9Q4S1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pde8bE9Q4S1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pde8bE9Q4S1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pde8bE9Q4S1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pde8bE9Q4S1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pde8bE9Q4S1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
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Pde8bE9Q4S1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pde8bE9Q4S1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
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Pde8bE9Q4S1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
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Pde8bE9Q4S1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pde8bE9Q4S1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
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Pde8bE9Q4S1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pde8bE9Q4S1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
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Pde8bE9Q4S1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Pde8bE9Q4S1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pde8bE9Q4S1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pde8bE9Q4S1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
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Pde8bE9Q4S1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pde8bE9Q4S1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pde8bE9Q4S1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
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Pde8bE9Q4S1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pde8bE9Q4S1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
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Pde8bE9Q4S1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
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Pde8bE9Q4S1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pde8bE9Q4S1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pde8bE9Q4S1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pde8bE9Q4S1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Pde8bE9Q4S1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pde8bE9Q4S1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pde8bE9Q4S1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pde8bE9Q4S1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Pde8bE9Q4S1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pde8bE9Q4S1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
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Pde8bE9Q4S1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pde8bE9Q4S1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pde8bE9Q4S1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pde8bE9Q4S1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pde8bE9Q4S1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Pde8bE9Q4S1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pde8bE9Q4S1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pde8bE9Q4S1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pde8bE9Q4S1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pde8bE9Q4S1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pde8bE9Q4S1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pde8bE9Q4S1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pde8bE9Q4S1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pde8bE9Q4S1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pde8bE9Q4S1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Pde8bE9Q4S1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms