Protein–RNA interactions for Protein: E9Q235

Vmn1r88, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r88E9Q235 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn1r88E9Q235 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn1r88E9Q235 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn1r88E9Q235 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn1r88E9Q235 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn1r88E9Q235 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r88E9Q235 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r88E9Q235 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r88E9Q235 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r88E9Q235 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r88E9Q235 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r88E9Q235 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn1r88E9Q235 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn1r88E9Q235 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn1r88E9Q235 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn1r88E9Q235 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn1r88E9Q235 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn1r88E9Q235 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r88E9Q235 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r88E9Q235 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r88E9Q235 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r88E9Q235 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r88E9Q235 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r88E9Q235 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r88E9Q235 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r88E9Q235 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r88E9Q235 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn1r88E9Q235 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn1r88E9Q235 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn1r88E9Q235 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn1r88E9Q235 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn1r88E9Q235 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn1r88E9Q235 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn1r88E9Q235 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r88E9Q235 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r88E9Q235 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r88E9Q235 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r88E9Q235 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r88E9Q235 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r88E9Q235 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r88E9Q235 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r88E9Q235 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r88E9Q235 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r88E9Q235 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r88E9Q235 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r88E9Q235 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r88E9Q235 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r88E9Q235 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r88E9Q235 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r88E9Q235 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r88E9Q235 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r88E9Q235 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r88E9Q235 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r88E9Q235 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r88E9Q235 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r88E9Q235 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r88E9Q235 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r88E9Q235 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r88E9Q235 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn1r88E9Q235 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn1r88E9Q235 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r88E9Q235 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r88E9Q235 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r88E9Q235 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r88E9Q235 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r88E9Q235 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r88E9Q235 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r88E9Q235 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r88E9Q235 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r88E9Q235 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r88E9Q235 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r88E9Q235 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r88E9Q235 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r88E9Q235 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r88E9Q235 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r88E9Q235 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r88E9Q235 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r88E9Q235 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r88E9Q235 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r88E9Q235 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r88E9Q235 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vmn1r88E9Q235 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r88E9Q235 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r88E9Q235 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r88E9Q235 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r88E9Q235 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r88E9Q235 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r88E9Q235 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r88E9Q235 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r88E9Q235 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r88E9Q235 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r88E9Q235 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r88E9Q235 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r88E9Q235 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r88E9Q235 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r88E9Q235 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r88E9Q235 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r88E9Q235 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r88E9Q235 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r88E9Q235 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms