Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc171E9Q1U1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc171E9Q1U1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc171E9Q1U1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc171E9Q1U1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Ccdc171E9Q1U1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc171E9Q1U1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc171E9Q1U1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc171E9Q1U1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc171E9Q1U1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc171E9Q1U1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc171E9Q1U1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc171E9Q1U1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc171E9Q1U1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc171E9Q1U1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc171E9Q1U1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc171E9Q1U1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc171E9Q1U1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc171E9Q1U1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc171E9Q1U1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc171E9Q1U1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc171E9Q1U1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc171E9Q1U1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc171E9Q1U1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc171E9Q1U1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc171E9Q1U1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc171E9Q1U1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc171E9Q1U1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc171E9Q1U1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc171E9Q1U1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc171E9Q1U1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc171E9Q1U1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc171E9Q1U1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc171E9Q1U1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc171E9Q1U1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc171E9Q1U1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc171E9Q1U1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc171E9Q1U1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc171E9Q1U1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc171E9Q1U1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc171E9Q1U1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc171E9Q1U1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc171E9Q1U1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc171E9Q1U1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc171E9Q1U1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc171E9Q1U1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc171E9Q1U1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc171E9Q1U1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc171E9Q1U1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc171E9Q1U1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc171E9Q1U1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc171E9Q1U1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc171E9Q1U1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc171E9Q1U1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc171E9Q1U1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc171E9Q1U1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc171E9Q1U1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc171E9Q1U1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc171E9Q1U1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc171E9Q1U1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc171E9Q1U1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc171E9Q1U1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc171E9Q1U1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc171E9Q1U1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc171E9Q1U1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc171E9Q1U1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc171E9Q1U1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc171E9Q1U1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc171E9Q1U1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc171E9Q1U1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc171E9Q1U1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc171E9Q1U1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc171E9Q1U1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ccdc171E9Q1U1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ccdc171E9Q1U1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc171E9Q1U1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc171E9Q1U1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc171E9Q1U1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc171E9Q1U1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc171E9Q1U1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc171E9Q1U1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc171E9Q1U1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc171E9Q1U1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc171E9Q1U1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc171E9Q1U1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc171E9Q1U1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc171E9Q1U1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc171E9Q1U1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc171E9Q1U1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc171E9Q1U1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc171E9Q1U1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
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