Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,46■■■■□ 3,27
Fndc1E9Q043 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35,45■■■■□ 3,27
Fndc1E9Q043 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,45■■■■□ 3,27
Fndc1E9Q043 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35,44■■■■□ 3,26
Fndc1E9Q043 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,44■■■■□ 3,26
Fndc1E9Q043 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC35,43■■■■□ 3,26
Fndc1E9Q043 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35,43■■■■□ 3,26
Fndc1E9Q043 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC35,43■■■■□ 3,26
Fndc1E9Q043 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC35,42■■■■□ 3,26
Fndc1E9Q043 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC35,41■■■■□ 3,26
Fndc1E9Q043 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,41■■■■□ 3,26
Fndc1E9Q043 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC35,4■■■■□ 3,26
Fndc1E9Q043 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC35,4■■■■□ 3,26
Fndc1E9Q043 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC35,4■■■■□ 3,26
Fndc1E9Q043 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35,4■■■■□ 3,26
Fndc1E9Q043 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,4■■■■□ 3,26
Fndc1E9Q043 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,39■■■■□ 3,26
Fndc1E9Q043 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC35,39■■■■□ 3,26
Fndc1E9Q043 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,26
Fndc1E9Q043 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Fndc1E9Q043 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC35,37■■■■□ 3,25
Fndc1E9Q043 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,37■■■■□ 3,25
Fndc1E9Q043 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,37■■■■□ 3,25
Fndc1E9Q043 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC35,37■■■■□ 3,25
Fndc1E9Q043 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35,36■■■■□ 3,25
Fndc1E9Q043 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,36■■■■□ 3,25
Fndc1E9Q043 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,36■■■■□ 3,25
Fndc1E9Q043 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,36■■■■□ 3,25
Fndc1E9Q043 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC35,35■■■■□ 3,25
Fndc1E9Q043 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,35■■■■□ 3,25
Fndc1E9Q043 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC35,35■■■■□ 3,25
Fndc1E9Q043 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,34■■■■□ 3,25
Fndc1E9Q043 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC35,33■■■■□ 3,25
Fndc1E9Q043 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC35,33■■■■□ 3,25
Fndc1E9Q043 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,24
Fndc1E9Q043 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,24
Fndc1E9Q043 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,32■■■■□ 3,24
Fndc1E9Q043 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,24
Fndc1E9Q043 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,31■■■■□ 3,24
Fndc1E9Q043 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC35,31■■■■□ 3,24
Fndc1E9Q043 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC35,3■■■■□ 3,24
Fndc1E9Q043 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,3■■■■□ 3,24
Fndc1E9Q043 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC35,29■■■■□ 3,24
Fndc1E9Q043 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35,29■■■■□ 3,24
Fndc1E9Q043 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC35,28■■■■□ 3,24
Fndc1E9Q043 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC35,27■■■■□ 3,24
Fndc1E9Q043 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,26■■■■□ 3,24
Fndc1E9Q043 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC35,26■■■■□ 3,23
Fndc1E9Q043 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC35,26■■■■□ 3,23
Fndc1E9Q043 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,25■■■■□ 3,23
Fndc1E9Q043 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC35,24■■■■□ 3,23
Fndc1E9Q043 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,24■■■■□ 3,23
Fndc1E9Q043 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35,21■■■■□ 3,23
Fndc1E9Q043 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC35,2■■■■□ 3,23
Fndc1E9Q043 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,23
Fndc1E9Q043 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC35,2■■■■□ 3,23
Fndc1E9Q043 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,23
Fndc1E9Q043 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,19■■■■□ 3,22
Fndc1E9Q043 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,19■■■■□ 3,22
Fndc1E9Q043 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
Fndc1E9Q043 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,17■■■■□ 3,22
Fndc1E9Q043 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,16■■■■□ 3,22
Fndc1E9Q043 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC35,16■■■■□ 3,22
Fndc1E9Q043 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,16■■■■□ 3,22
Fndc1E9Q043 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35,15■■■■□ 3,22
Fndc1E9Q043 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC35,15■■■■□ 3,22
Fndc1E9Q043 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,15■■■■□ 3,22
Fndc1E9Q043 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC35,15■■■■□ 3,22
Fndc1E9Q043 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC35,15■■■■□ 3,22
Fndc1E9Q043 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35,14■■■■□ 3,22
Fndc1E9Q043 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC35,13■■■■□ 3,21
Fndc1E9Q043 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC35,12■■■■□ 3,21
Fndc1E9Q043 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC35,12■■■■□ 3,21
Fndc1E9Q043 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
Fndc1E9Q043 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC35,1■■■■□ 3,21
Fndc1E9Q043 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC35,1■■■■□ 3,21
Fndc1E9Q043 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC35,09■■■■□ 3,21
Fndc1E9Q043 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,09■■■■□ 3,21
Fndc1E9Q043 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Fndc1E9Q043 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Fndc1E9Q043 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Fndc1E9Q043 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC35,07■■■■□ 3,21
Fndc1E9Q043 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC35,07■■■■□ 3,2
Fndc1E9Q043 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
Fndc1E9Q043 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,06■■■■□ 3,2
Fndc1E9Q043 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC35,06■■■■□ 3,2
Fndc1E9Q043 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
Fndc1E9Q043 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
Fndc1E9Q043 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Fndc1E9Q043 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC35,05■■■■□ 3,2
Fndc1E9Q043 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Fndc1E9Q043 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35,03■■■■□ 3,2
Fndc1E9Q043 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,03■■■■□ 3,2
Fndc1E9Q043 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,03■■■■□ 3,2
Fndc1E9Q043 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,03■■■■□ 3,2
Fndc1E9Q043 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,02■■■■□ 3,2
Fndc1E9Q043 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,02■■■■□ 3,2
Fndc1E9Q043 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,02■■■■□ 3,2
Fndc1E9Q043 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35,02■■■■□ 3,2
Fndc1E9Q043 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,01■■■■□ 3,2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23,1 ms