Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Brd1E9PZ26 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Brd1E9PZ26 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Brd1E9PZ26 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Brd1E9PZ26 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Brd1E9PZ26 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Brd1E9PZ26 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Brd1E9PZ26 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Brd1E9PZ26 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Brd1E9PZ26 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Brd1E9PZ26 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Brd1E9PZ26 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Brd1E9PZ26 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Brd1E9PZ26 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Brd1E9PZ26 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Brd1E9PZ26 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Brd1E9PZ26 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Brd1E9PZ26 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Brd1E9PZ26 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Brd1E9PZ26 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Brd1E9PZ26 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Brd1E9PZ26 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Brd1E9PZ26 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Brd1E9PZ26 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Brd1E9PZ26 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Brd1E9PZ26 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Brd1E9PZ26 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Brd1E9PZ26 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Brd1E9PZ26 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Brd1E9PZ26 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Brd1E9PZ26 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Brd1E9PZ26 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Brd1E9PZ26 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Brd1E9PZ26 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Brd1E9PZ26 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Brd1E9PZ26 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Brd1E9PZ26 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Brd1E9PZ26 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Brd1E9PZ26 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Brd1E9PZ26 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Brd1E9PZ26 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Brd1E9PZ26 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Brd1E9PZ26 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Brd1E9PZ26 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Brd1E9PZ26 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Brd1E9PZ26 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Brd1E9PZ26 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Brd1E9PZ26 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Brd1E9PZ26 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Brd1E9PZ26 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Brd1E9PZ26 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Brd1E9PZ26 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Brd1E9PZ26 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Brd1E9PZ26 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Brd1E9PZ26 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Brd1E9PZ26 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Brd1E9PZ26 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Brd1E9PZ26 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Brd1E9PZ26 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Brd1E9PZ26 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Brd1E9PZ26 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Brd1E9PZ26 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Brd1E9PZ26 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Brd1E9PZ26 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Brd1E9PZ26 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Brd1E9PZ26 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Brd1E9PZ26 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Brd1E9PZ26 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Brd1E9PZ26 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Brd1E9PZ26 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Brd1E9PZ26 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Brd1E9PZ26 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Brd1E9PZ26 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Brd1E9PZ26 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Brd1E9PZ26 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Brd1E9PZ26 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Brd1E9PZ26 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Brd1E9PZ26 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Brd1E9PZ26 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Brd1E9PZ26 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Brd1E9PZ26 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Brd1E9PZ26 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Brd1E9PZ26 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Brd1E9PZ26 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Brd1E9PZ26 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Brd1E9PZ26 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Brd1E9PZ26 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Brd1E9PZ26 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Brd1E9PZ26 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Brd1E9PZ26 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Brd1E9PZ26 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Brd1E9PZ26 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Brd1E9PZ26 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Brd1E9PZ26 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Brd1E9PZ26 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Brd1E9PZ26 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Brd1E9PZ26 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Brd1E9PZ26 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Brd1E9PZ26 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Brd1E9PZ26 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms