Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srp54bE9PXC0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srp54bE9PXC0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srp54bE9PXC0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srp54bE9PXC0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srp54bE9PXC0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srp54bE9PXC0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srp54bE9PXC0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srp54bE9PXC0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srp54bE9PXC0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srp54bE9PXC0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srp54bE9PXC0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srp54bE9PXC0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srp54bE9PXC0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srp54bE9PXC0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srp54bE9PXC0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srp54bE9PXC0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srp54bE9PXC0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srp54bE9PXC0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srp54bE9PXC0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srp54bE9PXC0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Srp54bE9PXC0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Srp54bE9PXC0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srp54bE9PXC0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srp54bE9PXC0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srp54bE9PXC0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srp54bE9PXC0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srp54bE9PXC0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srp54bE9PXC0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srp54bE9PXC0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srp54bE9PXC0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Srp54bE9PXC0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srp54bE9PXC0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srp54bE9PXC0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srp54bE9PXC0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srp54bE9PXC0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srp54bE9PXC0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srp54bE9PXC0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srp54bE9PXC0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srp54bE9PXC0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Srp54bE9PXC0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srp54bE9PXC0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srp54bE9PXC0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Srp54bE9PXC0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srp54bE9PXC0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srp54bE9PXC0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srp54bE9PXC0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srp54bE9PXC0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srp54bE9PXC0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srp54bE9PXC0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srp54bE9PXC0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srp54bE9PXC0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srp54bE9PXC0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srp54bE9PXC0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srp54bE9PXC0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srp54bE9PXC0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srp54bE9PXC0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srp54bE9PXC0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Srp54bE9PXC0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srp54bE9PXC0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srp54bE9PXC0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srp54bE9PXC0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srp54bE9PXC0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srp54bE9PXC0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srp54bE9PXC0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srp54bE9PXC0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srp54bE9PXC0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srp54bE9PXC0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srp54bE9PXC0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srp54bE9PXC0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srp54bE9PXC0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Srp54bE9PXC0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srp54bE9PXC0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srp54bE9PXC0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srp54bE9PXC0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srp54bE9PXC0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srp54bE9PXC0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srp54bE9PXC0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srp54bE9PXC0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srp54bE9PXC0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srp54bE9PXC0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srp54bE9PXC0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srp54bE9PXC0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srp54bE9PXC0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srp54bE9PXC0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srp54bE9PXC0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srp54bE9PXC0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srp54bE9PXC0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srp54bE9PXC0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srp54bE9PXC0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srp54bE9PXC0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srp54bE9PXC0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srp54bE9PXC0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srp54bE9PXC0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srp54bE9PXC0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srp54bE9PXC0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srp54bE9PXC0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srp54bE9PXC0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srp54bE9PXC0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srp54bE9PXC0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.7 ms