Protein–RNA interactions for Protein: E9PX29

Sptbn4, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn4E9PX29 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sptbn4E9PX29 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sptbn4E9PX29 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sptbn4E9PX29 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sptbn4E9PX29 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sptbn4E9PX29 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sptbn4E9PX29 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sptbn4E9PX29 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sptbn4E9PX29 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sptbn4E9PX29 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sptbn4E9PX29 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sptbn4E9PX29 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sptbn4E9PX29 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sptbn4E9PX29 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sptbn4E9PX29 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sptbn4E9PX29 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sptbn4E9PX29 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sptbn4E9PX29 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sptbn4E9PX29 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sptbn4E9PX29 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sptbn4E9PX29 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sptbn4E9PX29 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sptbn4E9PX29 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sptbn4E9PX29 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sptbn4E9PX29 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sptbn4E9PX29 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sptbn4E9PX29 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sptbn4E9PX29 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sptbn4E9PX29 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sptbn4E9PX29 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sptbn4E9PX29 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sptbn4E9PX29 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sptbn4E9PX29 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sptbn4E9PX29 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sptbn4E9PX29 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sptbn4E9PX29 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sptbn4E9PX29 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sptbn4E9PX29 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sptbn4E9PX29 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sptbn4E9PX29 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sptbn4E9PX29 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sptbn4E9PX29 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sptbn4E9PX29 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sptbn4E9PX29 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sptbn4E9PX29 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sptbn4E9PX29 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sptbn4E9PX29 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sptbn4E9PX29 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sptbn4E9PX29 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sptbn4E9PX29 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sptbn4E9PX29 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sptbn4E9PX29 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sptbn4E9PX29 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sptbn4E9PX29 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sptbn4E9PX29 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sptbn4E9PX29 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sptbn4E9PX29 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sptbn4E9PX29 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sptbn4E9PX29 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sptbn4E9PX29 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sptbn4E9PX29 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sptbn4E9PX29 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sptbn4E9PX29 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sptbn4E9PX29 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sptbn4E9PX29 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sptbn4E9PX29 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sptbn4E9PX29 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sptbn4E9PX29 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sptbn4E9PX29 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sptbn4E9PX29 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sptbn4E9PX29 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sptbn4E9PX29 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sptbn4E9PX29 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sptbn4E9PX29 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sptbn4E9PX29 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sptbn4E9PX29 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sptbn4E9PX29 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sptbn4E9PX29 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sptbn4E9PX29 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sptbn4E9PX29 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sptbn4E9PX29 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sptbn4E9PX29 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sptbn4E9PX29 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sptbn4E9PX29 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sptbn4E9PX29 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sptbn4E9PX29 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sptbn4E9PX29 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sptbn4E9PX29 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sptbn4E9PX29 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sptbn4E9PX29 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sptbn4E9PX29 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sptbn4E9PX29 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sptbn4E9PX29 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sptbn4E9PX29 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sptbn4E9PX29 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sptbn4E9PX29 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sptbn4E9PX29 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sptbn4E9PX29 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sptbn4E9PX29 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sptbn4E9PX29 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms