Protein–RNA interactions for Protein: E9PW74

Gimd1, GTPase IMAP family member GIMD1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimd1E9PW74 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gimd1E9PW74 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gimd1E9PW74 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Gimd1E9PW74 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gimd1E9PW74 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gimd1E9PW74 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gimd1E9PW74 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gimd1E9PW74 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Gimd1E9PW74 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gimd1E9PW74 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Gimd1E9PW74 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gimd1E9PW74 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gimd1E9PW74 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gimd1E9PW74 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gimd1E9PW74 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Gimd1E9PW74 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gimd1E9PW74 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gimd1E9PW74 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gimd1E9PW74 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gimd1E9PW74 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gimd1E9PW74 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gimd1E9PW74 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gimd1E9PW74 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gimd1E9PW74 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gimd1E9PW74 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gimd1E9PW74 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gimd1E9PW74 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gimd1E9PW74 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gimd1E9PW74 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gimd1E9PW74 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gimd1E9PW74 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gimd1E9PW74 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gimd1E9PW74 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gimd1E9PW74 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gimd1E9PW74 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gimd1E9PW74 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gimd1E9PW74 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gimd1E9PW74 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gimd1E9PW74 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gimd1E9PW74 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gimd1E9PW74 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gimd1E9PW74 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gimd1E9PW74 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gimd1E9PW74 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gimd1E9PW74 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gimd1E9PW74 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gimd1E9PW74 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gimd1E9PW74 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gimd1E9PW74 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gimd1E9PW74 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gimd1E9PW74 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gimd1E9PW74 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gimd1E9PW74 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gimd1E9PW74 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gimd1E9PW74 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gimd1E9PW74 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gimd1E9PW74 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gimd1E9PW74 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gimd1E9PW74 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gimd1E9PW74 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gimd1E9PW74 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gimd1E9PW74 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gimd1E9PW74 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gimd1E9PW74 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gimd1E9PW74 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gimd1E9PW74 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gimd1E9PW74 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gimd1E9PW74 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gimd1E9PW74 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gimd1E9PW74 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gimd1E9PW74 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Gimd1E9PW74 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gimd1E9PW74 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Gimd1E9PW74 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gimd1E9PW74 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gimd1E9PW74 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gimd1E9PW74 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gimd1E9PW74 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gimd1E9PW74 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gimd1E9PW74 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gimd1E9PW74 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gimd1E9PW74 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gimd1E9PW74 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gimd1E9PW74 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gimd1E9PW74 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gimd1E9PW74 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gimd1E9PW74 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gimd1E9PW74 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gimd1E9PW74 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gimd1E9PW74 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gimd1E9PW74 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gimd1E9PW74 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gimd1E9PW74 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gimd1E9PW74 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Gimd1E9PW74 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Gimd1E9PW74 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gimd1E9PW74 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gimd1E9PW74 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gimd1E9PW74 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Gimd1E9PW74 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms