Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Syde2E9PUP1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Syde2E9PUP1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Syde2E9PUP1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Syde2E9PUP1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Syde2E9PUP1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Syde2E9PUP1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Syde2E9PUP1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Syde2E9PUP1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Syde2E9PUP1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Syde2E9PUP1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Syde2E9PUP1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Syde2E9PUP1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Syde2E9PUP1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Syde2E9PUP1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Syde2E9PUP1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Syde2E9PUP1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Syde2E9PUP1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Syde2E9PUP1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Syde2E9PUP1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Syde2E9PUP1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Syde2E9PUP1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Syde2E9PUP1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Syde2E9PUP1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Syde2E9PUP1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Syde2E9PUP1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Syde2E9PUP1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Syde2E9PUP1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Syde2E9PUP1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Syde2E9PUP1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Syde2E9PUP1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Syde2E9PUP1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Syde2E9PUP1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Syde2E9PUP1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Syde2E9PUP1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Syde2E9PUP1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Syde2E9PUP1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Syde2E9PUP1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Syde2E9PUP1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Syde2E9PUP1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Syde2E9PUP1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Syde2E9PUP1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Syde2E9PUP1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Syde2E9PUP1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Syde2E9PUP1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Syde2E9PUP1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Syde2E9PUP1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Syde2E9PUP1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Syde2E9PUP1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Syde2E9PUP1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Syde2E9PUP1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Syde2E9PUP1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Syde2E9PUP1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Syde2E9PUP1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Syde2E9PUP1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Syde2E9PUP1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Syde2E9PUP1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Syde2E9PUP1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Syde2E9PUP1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Syde2E9PUP1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Syde2E9PUP1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Syde2E9PUP1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Syde2E9PUP1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Syde2E9PUP1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Syde2E9PUP1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Syde2E9PUP1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Syde2E9PUP1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Syde2E9PUP1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Syde2E9PUP1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Syde2E9PUP1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Syde2E9PUP1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Syde2E9PUP1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Syde2E9PUP1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Syde2E9PUP1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Syde2E9PUP1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Syde2E9PUP1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Syde2E9PUP1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Syde2E9PUP1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Syde2E9PUP1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Syde2E9PUP1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Syde2E9PUP1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Syde2E9PUP1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Syde2E9PUP1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Syde2E9PUP1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Syde2E9PUP1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Syde2E9PUP1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Syde2E9PUP1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Syde2E9PUP1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Syde2E9PUP1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Syde2E9PUP1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Syde2E9PUP1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Syde2E9PUP1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Syde2E9PUP1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Syde2E9PUP1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Syde2E9PUP1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Syde2E9PUP1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Syde2E9PUP1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Syde2E9PUP1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Syde2E9PUP1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Syde2E9PUP1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms