Protein–RNA interactions for Protein: E0CXC2

Gm28043, E3 ubiquitin-protein ligase RNF8, mousemouse

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28043E0CXC2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm28043E0CXC2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm28043E0CXC2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm28043E0CXC2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm28043E0CXC2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm28043E0CXC2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm28043E0CXC2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gm28043E0CXC2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm28043E0CXC2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm28043E0CXC2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm28043E0CXC2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm28043E0CXC2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm28043E0CXC2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm28043E0CXC2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm28043E0CXC2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm28043E0CXC2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm28043E0CXC2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm28043E0CXC2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28043E0CXC2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28043E0CXC2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28043E0CXC2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28043E0CXC2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28043E0CXC2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28043E0CXC2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm28043E0CXC2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm28043E0CXC2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm28043E0CXC2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm28043E0CXC2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm28043E0CXC2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm28043E0CXC2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm28043E0CXC2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm28043E0CXC2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm28043E0CXC2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm28043E0CXC2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm28043E0CXC2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm28043E0CXC2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm28043E0CXC2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm28043E0CXC2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm28043E0CXC2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm28043E0CXC2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm28043E0CXC2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm28043E0CXC2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm28043E0CXC2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm28043E0CXC2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm28043E0CXC2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm28043E0CXC2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm28043E0CXC2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm28043E0CXC2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm28043E0CXC2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm28043E0CXC2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm28043E0CXC2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm28043E0CXC2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm28043E0CXC2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm28043E0CXC2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm28043E0CXC2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm28043E0CXC2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm28043E0CXC2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm28043E0CXC2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm28043E0CXC2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm28043E0CXC2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm28043E0CXC2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm28043E0CXC2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm28043E0CXC2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm28043E0CXC2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm28043E0CXC2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm28043E0CXC2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm28043E0CXC2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm28043E0CXC2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm28043E0CXC2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm28043E0CXC2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm28043E0CXC2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm28043E0CXC2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm28043E0CXC2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm28043E0CXC2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm28043E0CXC2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm28043E0CXC2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm28043E0CXC2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm28043E0CXC2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm28043E0CXC2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm28043E0CXC2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm28043E0CXC2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm28043E0CXC2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm28043E0CXC2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm28043E0CXC2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm28043E0CXC2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm28043E0CXC2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm28043E0CXC2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm28043E0CXC2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm28043E0CXC2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm28043E0CXC2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm28043E0CXC2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm28043E0CXC2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm28043E0CXC2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm28043E0CXC2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm28043E0CXC2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm28043E0CXC2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm28043E0CXC2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm28043E0CXC2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm28043E0CXC2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm28043E0CXC2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms