Protein–RNA interactions for Protein: D3Z236

Gm3676, Predicted gene 3676, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3676D3Z236 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3676D3Z236 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3676D3Z236 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3676D3Z236 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3676D3Z236 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3676D3Z236 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3676D3Z236 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3676D3Z236 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3676D3Z236 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3676D3Z236 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3676D3Z236 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3676D3Z236 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3676D3Z236 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3676D3Z236 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3676D3Z236 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3676D3Z236 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3676D3Z236 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3676D3Z236 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3676D3Z236 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3676D3Z236 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3676D3Z236 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3676D3Z236 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3676D3Z236 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3676D3Z236 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3676D3Z236 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3676D3Z236 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3676D3Z236 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3676D3Z236 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3676D3Z236 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3676D3Z236 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3676D3Z236 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm3676D3Z236 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm3676D3Z236 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm3676D3Z236 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3676D3Z236 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3676D3Z236 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3676D3Z236 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3676D3Z236 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3676D3Z236 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3676D3Z236 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3676D3Z236 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3676D3Z236 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3676D3Z236 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3676D3Z236 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3676D3Z236 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3676D3Z236 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3676D3Z236 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3676D3Z236 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3676D3Z236 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3676D3Z236 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3676D3Z236 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3676D3Z236 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3676D3Z236 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3676D3Z236 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3676D3Z236 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3676D3Z236 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3676D3Z236 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3676D3Z236 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3676D3Z236 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3676D3Z236 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3676D3Z236 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3676D3Z236 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3676D3Z236 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3676D3Z236 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3676D3Z236 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3676D3Z236 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3676D3Z236 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3676D3Z236 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3676D3Z236 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3676D3Z236 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3676D3Z236 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3676D3Z236 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3676D3Z236 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3676D3Z236 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3676D3Z236 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3676D3Z236 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3676D3Z236 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gm3676D3Z236 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm3676D3Z236 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm3676D3Z236 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm3676D3Z236 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm3676D3Z236 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm3676D3Z236 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm3676D3Z236 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm3676D3Z236 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm3676D3Z236 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm3676D3Z236 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm3676D3Z236 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm3676D3Z236 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm3676D3Z236 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm3676D3Z236 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm3676D3Z236 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm3676D3Z236 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm3676D3Z236 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm3676D3Z236 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Gm3676D3Z236 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm3676D3Z236 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm3676D3Z236 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm3676D3Z236 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm3676D3Z236 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms