Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BC048679D3YXE9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BC048679D3YXE9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BC048679D3YXE9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BC048679D3YXE9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BC048679D3YXE9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BC048679D3YXE9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BC048679D3YXE9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BC048679D3YXE9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BC048679D3YXE9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BC048679D3YXE9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BC048679D3YXE9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BC048679D3YXE9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BC048679D3YXE9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BC048679D3YXE9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BC048679D3YXE9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BC048679D3YXE9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BC048679D3YXE9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BC048679D3YXE9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BC048679D3YXE9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BC048679D3YXE9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BC048679D3YXE9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BC048679D3YXE9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BC048679D3YXE9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BC048679D3YXE9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BC048679D3YXE9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BC048679D3YXE9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BC048679D3YXE9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BC048679D3YXE9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BC048679D3YXE9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BC048679D3YXE9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BC048679D3YXE9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BC048679D3YXE9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BC048679D3YXE9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BC048679D3YXE9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BC048679D3YXE9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BC048679D3YXE9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BC048679D3YXE9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BC048679D3YXE9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BC048679D3YXE9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BC048679D3YXE9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BC048679D3YXE9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BC048679D3YXE9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BC048679D3YXE9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BC048679D3YXE9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BC048679D3YXE9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BC048679D3YXE9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BC048679D3YXE9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BC048679D3YXE9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BC048679D3YXE9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BC048679D3YXE9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BC048679D3YXE9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BC048679D3YXE9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BC048679D3YXE9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BC048679D3YXE9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BC048679D3YXE9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BC048679D3YXE9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BC048679D3YXE9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BC048679D3YXE9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BC048679D3YXE9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BC048679D3YXE9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BC048679D3YXE9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BC048679D3YXE9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BC048679D3YXE9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BC048679D3YXE9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BC048679D3YXE9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BC048679D3YXE9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BC048679D3YXE9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BC048679D3YXE9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BC048679D3YXE9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BC048679D3YXE9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BC048679D3YXE9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BC048679D3YXE9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BC048679D3YXE9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BC048679D3YXE9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BC048679D3YXE9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BC048679D3YXE9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BC048679D3YXE9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
BC048679D3YXE9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BC048679D3YXE9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BC048679D3YXE9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BC048679D3YXE9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BC048679D3YXE9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BC048679D3YXE9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BC048679D3YXE9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BC048679D3YXE9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BC048679D3YXE9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BC048679D3YXE9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BC048679D3YXE9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BC048679D3YXE9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BC048679D3YXE9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BC048679D3YXE9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BC048679D3YXE9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BC048679D3YXE9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BC048679D3YXE9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BC048679D3YXE9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BC048679D3YXE9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BC048679D3YXE9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BC048679D3YXE9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BC048679D3YXE9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms