Protein–RNA interactions for Protein: D3YWC7

Fam47e, Family with sequence similarity 47, member E, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47eD3YWC7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam47eD3YWC7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam47eD3YWC7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam47eD3YWC7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam47eD3YWC7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam47eD3YWC7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam47eD3YWC7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam47eD3YWC7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam47eD3YWC7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam47eD3YWC7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam47eD3YWC7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam47eD3YWC7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam47eD3YWC7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam47eD3YWC7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam47eD3YWC7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam47eD3YWC7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam47eD3YWC7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam47eD3YWC7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam47eD3YWC7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fam47eD3YWC7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam47eD3YWC7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam47eD3YWC7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam47eD3YWC7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam47eD3YWC7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam47eD3YWC7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam47eD3YWC7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam47eD3YWC7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam47eD3YWC7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam47eD3YWC7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam47eD3YWC7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam47eD3YWC7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam47eD3YWC7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam47eD3YWC7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam47eD3YWC7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam47eD3YWC7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam47eD3YWC7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam47eD3YWC7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam47eD3YWC7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam47eD3YWC7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam47eD3YWC7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam47eD3YWC7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam47eD3YWC7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam47eD3YWC7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam47eD3YWC7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam47eD3YWC7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam47eD3YWC7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam47eD3YWC7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam47eD3YWC7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam47eD3YWC7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam47eD3YWC7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam47eD3YWC7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam47eD3YWC7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam47eD3YWC7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam47eD3YWC7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam47eD3YWC7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam47eD3YWC7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam47eD3YWC7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam47eD3YWC7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam47eD3YWC7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam47eD3YWC7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam47eD3YWC7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam47eD3YWC7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam47eD3YWC7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam47eD3YWC7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam47eD3YWC7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam47eD3YWC7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam47eD3YWC7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam47eD3YWC7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam47eD3YWC7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam47eD3YWC7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam47eD3YWC7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam47eD3YWC7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam47eD3YWC7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam47eD3YWC7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam47eD3YWC7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam47eD3YWC7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam47eD3YWC7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam47eD3YWC7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam47eD3YWC7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam47eD3YWC7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam47eD3YWC7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam47eD3YWC7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam47eD3YWC7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam47eD3YWC7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam47eD3YWC7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam47eD3YWC7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam47eD3YWC7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam47eD3YWC7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam47eD3YWC7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam47eD3YWC7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam47eD3YWC7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam47eD3YWC7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam47eD3YWC7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam47eD3YWC7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam47eD3YWC7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam47eD3YWC7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam47eD3YWC7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam47eD3YWC7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam47eD3YWC7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam47eD3YWC7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms