Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK8

1700015F17Rik, RIKEN cDNA 1700015F17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700015F17RikD3YUK8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700015F17RikD3YUK8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700015F17RikD3YUK8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700015F17RikD3YUK8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700015F17RikD3YUK8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700015F17RikD3YUK8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
1700015F17RikD3YUK8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700015F17RikD3YUK8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700015F17RikD3YUK8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700015F17RikD3YUK8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700015F17RikD3YUK8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700015F17RikD3YUK8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
1700015F17RikD3YUK8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700015F17RikD3YUK8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700015F17RikD3YUK8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700015F17RikD3YUK8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700015F17RikD3YUK8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700015F17RikD3YUK8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700015F17RikD3YUK8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700015F17RikD3YUK8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700015F17RikD3YUK8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700015F17RikD3YUK8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700015F17RikD3YUK8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700015F17RikD3YUK8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700015F17RikD3YUK8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700015F17RikD3YUK8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700015F17RikD3YUK8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700015F17RikD3YUK8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700015F17RikD3YUK8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700015F17RikD3YUK8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700015F17RikD3YUK8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700015F17RikD3YUK8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700015F17RikD3YUK8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700015F17RikD3YUK8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700015F17RikD3YUK8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700015F17RikD3YUK8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700015F17RikD3YUK8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700015F17RikD3YUK8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700015F17RikD3YUK8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
1700015F17RikD3YUK8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700015F17RikD3YUK8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700015F17RikD3YUK8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700015F17RikD3YUK8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700015F17RikD3YUK8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700015F17RikD3YUK8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700015F17RikD3YUK8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700015F17RikD3YUK8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700015F17RikD3YUK8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700015F17RikD3YUK8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700015F17RikD3YUK8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700015F17RikD3YUK8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700015F17RikD3YUK8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700015F17RikD3YUK8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700015F17RikD3YUK8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
1700015F17RikD3YUK8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700015F17RikD3YUK8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700015F17RikD3YUK8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700015F17RikD3YUK8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700015F17RikD3YUK8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700015F17RikD3YUK8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700015F17RikD3YUK8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700015F17RikD3YUK8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700015F17RikD3YUK8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700015F17RikD3YUK8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700015F17RikD3YUK8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700015F17RikD3YUK8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
1700015F17RikD3YUK8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700015F17RikD3YUK8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700015F17RikD3YUK8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
1700015F17RikD3YUK8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
1700015F17RikD3YUK8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700015F17RikD3YUK8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700015F17RikD3YUK8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700015F17RikD3YUK8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700015F17RikD3YUK8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700015F17RikD3YUK8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700015F17RikD3YUK8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700015F17RikD3YUK8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700015F17RikD3YUK8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700015F17RikD3YUK8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700015F17RikD3YUK8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700015F17RikD3YUK8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700015F17RikD3YUK8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700015F17RikD3YUK8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700015F17RikD3YUK8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700015F17RikD3YUK8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700015F17RikD3YUK8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700015F17RikD3YUK8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700015F17RikD3YUK8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700015F17RikD3YUK8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700015F17RikD3YUK8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700015F17RikD3YUK8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700015F17RikD3YUK8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700015F17RikD3YUK8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700015F17RikD3YUK8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700015F17RikD3YUK8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700015F17RikD3YUK8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700015F17RikD3YUK8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700015F17RikD3YUK8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700015F17RikD3YUK8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms