Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm17333C6EQI3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm17333C6EQI3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm17333C6EQI3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm17333C6EQI3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm17333C6EQI3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm17333C6EQI3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms