Protein–RNA interactions for Protein: B9EJU1

Gm1141, Gene model 1141, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1141B9EJU1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm1141B9EJU1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm1141B9EJU1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm1141B9EJU1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm1141B9EJU1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm1141B9EJU1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm1141B9EJU1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm1141B9EJU1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm1141B9EJU1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm1141B9EJU1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm1141B9EJU1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm1141B9EJU1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm1141B9EJU1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm1141B9EJU1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm1141B9EJU1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm1141B9EJU1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm1141B9EJU1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm1141B9EJU1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm1141B9EJU1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm1141B9EJU1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm1141B9EJU1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm1141B9EJU1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm1141B9EJU1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm1141B9EJU1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm1141B9EJU1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm1141B9EJU1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm1141B9EJU1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm1141B9EJU1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm1141B9EJU1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm1141B9EJU1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm1141B9EJU1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm1141B9EJU1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm1141B9EJU1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm1141B9EJU1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm1141B9EJU1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm1141B9EJU1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm1141B9EJU1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm1141B9EJU1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm1141B9EJU1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm1141B9EJU1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm1141B9EJU1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm1141B9EJU1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm1141B9EJU1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm1141B9EJU1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm1141B9EJU1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm1141B9EJU1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm1141B9EJU1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm1141B9EJU1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm1141B9EJU1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm1141B9EJU1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm1141B9EJU1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm1141B9EJU1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm1141B9EJU1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm1141B9EJU1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm1141B9EJU1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm1141B9EJU1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm1141B9EJU1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm1141B9EJU1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm1141B9EJU1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm1141B9EJU1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm1141B9EJU1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm1141B9EJU1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm1141B9EJU1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm1141B9EJU1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm1141B9EJU1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm1141B9EJU1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm1141B9EJU1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm1141B9EJU1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm1141B9EJU1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm1141B9EJU1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm1141B9EJU1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm1141B9EJU1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm1141B9EJU1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm1141B9EJU1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm1141B9EJU1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm1141B9EJU1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm1141B9EJU1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm1141B9EJU1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm1141B9EJU1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm1141B9EJU1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm1141B9EJU1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm1141B9EJU1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm1141B9EJU1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm1141B9EJU1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm1141B9EJU1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm1141B9EJU1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm1141B9EJU1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm1141B9EJU1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm1141B9EJU1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm1141B9EJU1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm1141B9EJU1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm1141B9EJU1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm1141B9EJU1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm1141B9EJU1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm1141B9EJU1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm1141B9EJU1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm1141B9EJU1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm1141B9EJU1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm1141B9EJU1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm1141B9EJU1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms