Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
Cttnbp2B9EJA2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
Cttnbp2B9EJA2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
Cttnbp2B9EJA2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
Cttnbp2B9EJA2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Cttnbp2B9EJA2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Cttnbp2B9EJA2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
Cttnbp2B9EJA2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Cttnbp2B9EJA2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Cttnbp2B9EJA2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Cttnbp2B9EJA2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC40.65■■■■■ 4.1
Cttnbp2B9EJA2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Cttnbp2B9EJA2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Cttnbp2B9EJA2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
Cttnbp2B9EJA2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
Cttnbp2B9EJA2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Cttnbp2B9EJA2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Cttnbp2B9EJA2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Cttnbp2B9EJA2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
Cttnbp2B9EJA2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Cttnbp2B9EJA2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.09
Cttnbp2B9EJA2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
Cttnbp2B9EJA2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
Cttnbp2B9EJA2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
Cttnbp2B9EJA2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Cttnbp2B9EJA2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Cttnbp2B9EJA2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Cttnbp2B9EJA2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Cttnbp2B9EJA2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC40.5■■■■■ 4.07
Cttnbp2B9EJA2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Cttnbp2B9EJA2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Cttnbp2B9EJA2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Cttnbp2B9EJA2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Cttnbp2B9EJA2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Cttnbp2B9EJA2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC40.46■■■■■ 4.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
Cttnbp2B9EJA2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Cttnbp2B9EJA2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC40.45■■■■■ 4.07
Cttnbp2B9EJA2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Cttnbp2B9EJA2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
Cttnbp2B9EJA2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Cttnbp2B9EJA2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Cttnbp2B9EJA2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Cttnbp2B9EJA2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
Cttnbp2B9EJA2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
Cttnbp2B9EJA2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
Cttnbp2B9EJA2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Cttnbp2B9EJA2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Cttnbp2B9EJA2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Cttnbp2B9EJA2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Cttnbp2B9EJA2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Cttnbp2B9EJA2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Cttnbp2B9EJA2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Cttnbp2B9EJA2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Cttnbp2B9EJA2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
Cttnbp2B9EJA2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Cttnbp2B9EJA2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Cttnbp2B9EJA2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Cttnbp2B9EJA2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Cttnbp2B9EJA2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Cttnbp2B9EJA2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
Cttnbp2B9EJA2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Cttnbp2B9EJA2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
Cttnbp2B9EJA2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Cttnbp2B9EJA2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Cttnbp2B9EJA2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC40.31■■■■■ 4.04
Cttnbp2B9EJA2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
Cttnbp2B9EJA2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC40.31■■■■■ 4.04
Cttnbp2B9EJA2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
Cttnbp2B9EJA2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Cttnbp2B9EJA2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC40.27■■■■■ 4.04
Cttnbp2B9EJA2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Cttnbp2B9EJA2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Cttnbp2B9EJA2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
Cttnbp2B9EJA2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
Cttnbp2B9EJA2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Cttnbp2B9EJA2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Cttnbp2B9EJA2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Cttnbp2B9EJA2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
Cttnbp2B9EJA2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Cttnbp2B9EJA2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Cttnbp2B9EJA2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Cttnbp2B9EJA2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
Cttnbp2B9EJA2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
Cttnbp2B9EJA2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC40.21■■■■■ 4.03
Cttnbp2B9EJA2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC40.2■■■■■ 4.03
Cttnbp2B9EJA2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Cttnbp2B9EJA2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms