Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3173A6NAS3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3173A6NAS3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3173A6NAS3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3173A6NAS3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3173A6NAS3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3173A6NAS3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3173A6NAS3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3173A6NAS3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3173A6NAS3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3173A6NAS3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3173A6NAS3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3173A6NAS3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm3173A6NAS3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm3173A6NAS3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm3173A6NAS3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm3173A6NAS3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3173A6NAS3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3173A6NAS3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3173A6NAS3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3173A6NAS3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3173A6NAS3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3173A6NAS3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3173A6NAS3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3173A6NAS3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3173A6NAS3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3173A6NAS3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3173A6NAS3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3173A6NAS3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3173A6NAS3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3173A6NAS3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3173A6NAS3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3173A6NAS3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3173A6NAS3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3173A6NAS3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3173A6NAS3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3173A6NAS3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3173A6NAS3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3173A6NAS3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3173A6NAS3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3173A6NAS3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3173A6NAS3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3173A6NAS3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3173A6NAS3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3173A6NAS3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3173A6NAS3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3173A6NAS3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3173A6NAS3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3173A6NAS3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3173A6NAS3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3173A6NAS3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3173A6NAS3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3173A6NAS3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3173A6NAS3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3173A6NAS3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3173A6NAS3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3173A6NAS3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3173A6NAS3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3173A6NAS3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3173A6NAS3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3173A6NAS3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3173A6NAS3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3173A6NAS3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3173A6NAS3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3173A6NAS3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3173A6NAS3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3173A6NAS3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3173A6NAS3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3173A6NAS3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3173A6NAS3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3173A6NAS3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3173A6NAS3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3173A6NAS3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3173A6NAS3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3173A6NAS3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3173A6NAS3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3173A6NAS3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3173A6NAS3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3173A6NAS3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3173A6NAS3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3173A6NAS3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3173A6NAS3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3173A6NAS3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3173A6NAS3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3173A6NAS3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3173A6NAS3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3173A6NAS3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3173A6NAS3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3173A6NAS3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3173A6NAS3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3173A6NAS3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3173A6NAS3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3173A6NAS3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3173A6NAS3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3173A6NAS3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3173A6NAS3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3173A6NAS3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3173A6NAS3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3173A6NAS3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3173A6NAS3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms