Protein–RNA interactions for Protein: A6H5Y3

Mtr, Methionine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MtrA6H5Y3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MtrA6H5Y3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MtrA6H5Y3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MtrA6H5Y3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MtrA6H5Y3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MtrA6H5Y3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MtrA6H5Y3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MtrA6H5Y3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MtrA6H5Y3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MtrA6H5Y3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MtrA6H5Y3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MtrA6H5Y3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MtrA6H5Y3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MtrA6H5Y3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MtrA6H5Y3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MtrA6H5Y3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MtrA6H5Y3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MtrA6H5Y3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MtrA6H5Y3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MtrA6H5Y3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MtrA6H5Y3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MtrA6H5Y3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MtrA6H5Y3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MtrA6H5Y3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MtrA6H5Y3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MtrA6H5Y3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MtrA6H5Y3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MtrA6H5Y3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MtrA6H5Y3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MtrA6H5Y3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MtrA6H5Y3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MtrA6H5Y3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MtrA6H5Y3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MtrA6H5Y3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MtrA6H5Y3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MtrA6H5Y3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MtrA6H5Y3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MtrA6H5Y3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MtrA6H5Y3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MtrA6H5Y3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MtrA6H5Y3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MtrA6H5Y3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MtrA6H5Y3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MtrA6H5Y3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MtrA6H5Y3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MtrA6H5Y3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MtrA6H5Y3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MtrA6H5Y3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MtrA6H5Y3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MtrA6H5Y3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MtrA6H5Y3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MtrA6H5Y3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MtrA6H5Y3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MtrA6H5Y3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MtrA6H5Y3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MtrA6H5Y3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MtrA6H5Y3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MtrA6H5Y3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MtrA6H5Y3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MtrA6H5Y3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MtrA6H5Y3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MtrA6H5Y3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MtrA6H5Y3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MtrA6H5Y3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MtrA6H5Y3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MtrA6H5Y3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MtrA6H5Y3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MtrA6H5Y3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MtrA6H5Y3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MtrA6H5Y3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MtrA6H5Y3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MtrA6H5Y3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MtrA6H5Y3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MtrA6H5Y3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MtrA6H5Y3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MtrA6H5Y3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MtrA6H5Y3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MtrA6H5Y3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MtrA6H5Y3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MtrA6H5Y3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MtrA6H5Y3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MtrA6H5Y3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MtrA6H5Y3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MtrA6H5Y3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MtrA6H5Y3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MtrA6H5Y3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MtrA6H5Y3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MtrA6H5Y3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MtrA6H5Y3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MtrA6H5Y3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MtrA6H5Y3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MtrA6H5Y3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MtrA6H5Y3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MtrA6H5Y3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MtrA6H5Y3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MtrA6H5Y3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MtrA6H5Y3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MtrA6H5Y3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MtrA6H5Y3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MtrA6H5Y3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms