Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9E8

Ttll6, Tubulin polyglutamylase TTLL6, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll6A4Q9E8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ttll6A4Q9E8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ttll6A4Q9E8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ttll6A4Q9E8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttll6A4Q9E8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttll6A4Q9E8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttll6A4Q9E8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttll6A4Q9E8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttll6A4Q9E8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttll6A4Q9E8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttll6A4Q9E8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttll6A4Q9E8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttll6A4Q9E8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttll6A4Q9E8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttll6A4Q9E8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttll6A4Q9E8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttll6A4Q9E8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttll6A4Q9E8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttll6A4Q9E8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttll6A4Q9E8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttll6A4Q9E8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttll6A4Q9E8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttll6A4Q9E8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttll6A4Q9E8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttll6A4Q9E8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttll6A4Q9E8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttll6A4Q9E8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttll6A4Q9E8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttll6A4Q9E8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttll6A4Q9E8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttll6A4Q9E8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttll6A4Q9E8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttll6A4Q9E8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttll6A4Q9E8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttll6A4Q9E8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttll6A4Q9E8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttll6A4Q9E8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttll6A4Q9E8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttll6A4Q9E8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttll6A4Q9E8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttll6A4Q9E8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttll6A4Q9E8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttll6A4Q9E8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttll6A4Q9E8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttll6A4Q9E8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ttll6A4Q9E8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttll6A4Q9E8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttll6A4Q9E8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttll6A4Q9E8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttll6A4Q9E8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttll6A4Q9E8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttll6A4Q9E8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttll6A4Q9E8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttll6A4Q9E8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttll6A4Q9E8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttll6A4Q9E8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttll6A4Q9E8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttll6A4Q9E8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttll6A4Q9E8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttll6A4Q9E8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttll6A4Q9E8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttll6A4Q9E8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttll6A4Q9E8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttll6A4Q9E8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttll6A4Q9E8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttll6A4Q9E8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttll6A4Q9E8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttll6A4Q9E8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttll6A4Q9E8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttll6A4Q9E8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttll6A4Q9E8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttll6A4Q9E8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttll6A4Q9E8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttll6A4Q9E8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttll6A4Q9E8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttll6A4Q9E8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttll6A4Q9E8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttll6A4Q9E8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttll6A4Q9E8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttll6A4Q9E8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttll6A4Q9E8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttll6A4Q9E8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttll6A4Q9E8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttll6A4Q9E8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttll6A4Q9E8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttll6A4Q9E8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttll6A4Q9E8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttll6A4Q9E8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttll6A4Q9E8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttll6A4Q9E8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttll6A4Q9E8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttll6A4Q9E8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttll6A4Q9E8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttll6A4Q9E8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttll6A4Q9E8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ttll6A4Q9E8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttll6A4Q9E8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttll6A4Q9E8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttll6A4Q9E8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttll6A4Q9E8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms