Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp8b5A3FIN4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp8b5A3FIN4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp8b5A3FIN4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp8b5A3FIN4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp8b5A3FIN4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp8b5A3FIN4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp8b5A3FIN4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp8b5A3FIN4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp8b5A3FIN4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp8b5A3FIN4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp8b5A3FIN4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp8b5A3FIN4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp8b5A3FIN4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp8b5A3FIN4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp8b5A3FIN4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp8b5A3FIN4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp8b5A3FIN4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp8b5A3FIN4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp8b5A3FIN4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp8b5A3FIN4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp8b5A3FIN4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp8b5A3FIN4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp8b5A3FIN4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp8b5A3FIN4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp8b5A3FIN4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp8b5A3FIN4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp8b5A3FIN4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp8b5A3FIN4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp8b5A3FIN4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp8b5A3FIN4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp8b5A3FIN4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp8b5A3FIN4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp8b5A3FIN4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp8b5A3FIN4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp8b5A3FIN4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp8b5A3FIN4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp8b5A3FIN4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp8b5A3FIN4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp8b5A3FIN4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp8b5A3FIN4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp8b5A3FIN4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp8b5A3FIN4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp8b5A3FIN4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp8b5A3FIN4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp8b5A3FIN4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp8b5A3FIN4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp8b5A3FIN4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp8b5A3FIN4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp8b5A3FIN4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp8b5A3FIN4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atp8b5A3FIN4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atp8b5A3FIN4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp8b5A3FIN4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp8b5A3FIN4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp8b5A3FIN4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp8b5A3FIN4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp8b5A3FIN4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp8b5A3FIN4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp8b5A3FIN4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp8b5A3FIN4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp8b5A3FIN4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp8b5A3FIN4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp8b5A3FIN4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp8b5A3FIN4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp8b5A3FIN4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp8b5A3FIN4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp8b5A3FIN4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp8b5A3FIN4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp8b5A3FIN4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp8b5A3FIN4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp8b5A3FIN4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp8b5A3FIN4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp8b5A3FIN4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp8b5A3FIN4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp8b5A3FIN4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp8b5A3FIN4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp8b5A3FIN4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp8b5A3FIN4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp8b5A3FIN4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp8b5A3FIN4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp8b5A3FIN4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp8b5A3FIN4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp8b5A3FIN4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp8b5A3FIN4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp8b5A3FIN4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp8b5A3FIN4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp8b5A3FIN4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp8b5A3FIN4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp8b5A3FIN4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp8b5A3FIN4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp8b5A3FIN4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp8b5A3FIN4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp8b5A3FIN4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp8b5A3FIN4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp8b5A3FIN4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp8b5A3FIN4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp8b5A3FIN4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp8b5A3FIN4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp8b5A3FIN4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
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