Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
GabreA2AMW3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
GabreA2AMW3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
GabreA2AMW3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27,58■■■□□ 2,01
GabreA2AMW3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27,58■■■□□ 2,01
GabreA2AMW3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
GabreA2AMW3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
GabreA2AMW3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27,57■■■□□ 2
GabreA2AMW3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27,57■■■□□ 2
GabreA2AMW3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27,57■■■□□ 2
GabreA2AMW3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,56■■■□□ 2
GabreA2AMW3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27,56■■■□□ 2
GabreA2AMW3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
GabreA2AMW3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
GabreA2AMW3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
GabreA2AMW3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27,55■■■□□ 2
GabreA2AMW3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
GabreA2AMW3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27,54■■■□□ 2
GabreA2AMW3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27,54■■■□□ 2
GabreA2AMW3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
GabreA2AMW3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27,53■■■□□ 2
GabreA2AMW3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
GabreA2AMW3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
GabreA2AMW3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
GabreA2AMW3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
GabreA2AMW3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,52■■■□□ 2
GabreA2AMW3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
GabreA2AMW3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
GabreA2AMW3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
GabreA2AMW3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
GabreA2AMW3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
GabreA2AMW3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
GabreA2AMW3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27,5■■□□□ 1,99
GabreA2AMW3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
GabreA2AMW3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
GabreA2AMW3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,48■■□□□ 1,99
GabreA2AMW3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27,48■■□□□ 1,99
GabreA2AMW3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27,48■■□□□ 1,99
GabreA2AMW3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,48■■□□□ 1,99
GabreA2AMW3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27,47■■□□□ 1,99
GabreA2AMW3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27,46■■□□□ 1,99
GabreA2AMW3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27,46■■□□□ 1,99
GabreA2AMW3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
GabreA2AMW3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27,46■■□□□ 1,99
GabreA2AMW3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
GabreA2AMW3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27,44■■□□□ 1,98
GabreA2AMW3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27,43■■□□□ 1,98
GabreA2AMW3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,43■■□□□ 1,98
GabreA2AMW3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27,43■■□□□ 1,98
GabreA2AMW3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
GabreA2AMW3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27,43■■□□□ 1,98
GabreA2AMW3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27,42■■□□□ 1,98
GabreA2AMW3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
GabreA2AMW3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
GabreA2AMW3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
GabreA2AMW3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27,4■■□□□ 1,98
GabreA2AMW3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
GabreA2AMW3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
GabreA2AMW3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,39■■□□□ 1,97
GabreA2AMW3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
GabreA2AMW3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
GabreA2AMW3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27,37■■□□□ 1,97
GabreA2AMW3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
GabreA2AMW3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27,36■■□□□ 1,97
GabreA2AMW3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
GabreA2AMW3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27,35■■□□□ 1,97
GabreA2AMW3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27,35■■□□□ 1,97
GabreA2AMW3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,34■■□□□ 1,97
GabreA2AMW3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
GabreA2AMW3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
GabreA2AMW3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27,33■■□□□ 1,97
GabreA2AMW3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27,33■■□□□ 1,97
GabreA2AMW3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27,32■■□□□ 1,96
GabreA2AMW3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27,32■■□□□ 1,96
GabreA2AMW3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
GabreA2AMW3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
GabreA2AMW3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,31■■□□□ 1,96
GabreA2AMW3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
GabreA2AMW3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27,3■■□□□ 1,96
GabreA2AMW3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
GabreA2AMW3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,29■■□□□ 1,96
GabreA2AMW3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27,29■■□□□ 1,96
GabreA2AMW3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
GabreA2AMW3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
GabreA2AMW3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27,28■■□□□ 1,96
GabreA2AMW3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
GabreA2AMW3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27,27■■□□□ 1,96
GabreA2AMW3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27,27■■□□□ 1,96
GabreA2AMW3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27,27■■□□□ 1,96
GabreA2AMW3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
GabreA2AMW3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27,26■■□□□ 1,95
GabreA2AMW3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
GabreA2AMW3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,25■■□□□ 1,95
GabreA2AMW3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
GabreA2AMW3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,25■■□□□ 1,95
GabreA2AMW3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
GabreA2AMW3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
GabreA2AMW3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
GabreA2AMW3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
GabreA2AMW3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,9 ms