Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SetxA2AKX3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SetxA2AKX3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SetxA2AKX3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SetxA2AKX3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SetxA2AKX3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SetxA2AKX3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SetxA2AKX3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SetxA2AKX3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SetxA2AKX3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SetxA2AKX3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SetxA2AKX3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SetxA2AKX3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SetxA2AKX3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SetxA2AKX3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SetxA2AKX3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SetxA2AKX3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SetxA2AKX3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SetxA2AKX3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SetxA2AKX3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SetxA2AKX3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SetxA2AKX3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SetxA2AKX3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SetxA2AKX3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SetxA2AKX3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SetxA2AKX3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SetxA2AKX3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SetxA2AKX3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SetxA2AKX3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SetxA2AKX3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SetxA2AKX3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SetxA2AKX3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SetxA2AKX3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SetxA2AKX3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SetxA2AKX3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SetxA2AKX3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SetxA2AKX3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SetxA2AKX3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SetxA2AKX3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SetxA2AKX3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SetxA2AKX3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SetxA2AKX3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SetxA2AKX3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SetxA2AKX3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SetxA2AKX3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SetxA2AKX3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SetxA2AKX3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SetxA2AKX3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SetxA2AKX3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SetxA2AKX3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SetxA2AKX3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SetxA2AKX3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SetxA2AKX3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SetxA2AKX3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SetxA2AKX3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SetxA2AKX3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SetxA2AKX3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SetxA2AKX3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SetxA2AKX3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SetxA2AKX3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SetxA2AKX3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SetxA2AKX3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SetxA2AKX3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SetxA2AKX3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SetxA2AKX3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SetxA2AKX3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SetxA2AKX3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SetxA2AKX3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SetxA2AKX3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SetxA2AKX3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SetxA2AKX3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SetxA2AKX3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SetxA2AKX3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SetxA2AKX3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SetxA2AKX3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SetxA2AKX3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SetxA2AKX3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SetxA2AKX3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SetxA2AKX3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SetxA2AKX3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SetxA2AKX3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SetxA2AKX3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SetxA2AKX3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SetxA2AKX3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SetxA2AKX3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SetxA2AKX3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SetxA2AKX3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SetxA2AKX3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SetxA2AKX3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SetxA2AKX3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SetxA2AKX3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SetxA2AKX3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SetxA2AKX3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SetxA2AKX3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SetxA2AKX3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SetxA2AKX3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SetxA2AKX3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SetxA2AKX3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SetxA2AKX3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SetxA2AKX3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.8 ms