Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ambra1A2AH22 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ambra1A2AH22 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ambra1A2AH22 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ambra1A2AH22 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Ambra1A2AH22 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Ambra1A2AH22 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ambra1A2AH22 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ambra1A2AH22 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ambra1A2AH22 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Ambra1A2AH22 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ambra1A2AH22 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ambra1A2AH22 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ambra1A2AH22 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ambra1A2AH22 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ambra1A2AH22 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ambra1A2AH22 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ambra1A2AH22 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ambra1A2AH22 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ambra1A2AH22 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ambra1A2AH22 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ambra1A2AH22 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ambra1A2AH22 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Ambra1A2AH22 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ambra1A2AH22 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ambra1A2AH22 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ambra1A2AH22 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ambra1A2AH22 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ambra1A2AH22 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ambra1A2AH22 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ambra1A2AH22 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ambra1A2AH22 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ambra1A2AH22 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ambra1A2AH22 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ambra1A2AH22 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ambra1A2AH22 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Ambra1A2AH22 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ambra1A2AH22 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ambra1A2AH22 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ambra1A2AH22 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ambra1A2AH22 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ambra1A2AH22 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ambra1A2AH22 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ambra1A2AH22 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ambra1A2AH22 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ambra1A2AH22 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ambra1A2AH22 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ambra1A2AH22 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ambra1A2AH22 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ambra1A2AH22 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ambra1A2AH22 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ambra1A2AH22 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ambra1A2AH22 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ambra1A2AH22 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ambra1A2AH22 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ambra1A2AH22 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ambra1A2AH22 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ambra1A2AH22 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Ambra1A2AH22 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ambra1A2AH22 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ambra1A2AH22 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ambra1A2AH22 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ambra1A2AH22 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ambra1A2AH22 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ambra1A2AH22 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ambra1A2AH22 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Ambra1A2AH22 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ambra1A2AH22 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ambra1A2AH22 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ambra1A2AH22 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ambra1A2AH22 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ambra1A2AH22 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ambra1A2AH22 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ambra1A2AH22 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ambra1A2AH22 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ambra1A2AH22 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Ambra1A2AH22 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Ambra1A2AH22 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ambra1A2AH22 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ambra1A2AH22 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ambra1A2AH22 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ambra1A2AH22 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ambra1A2AH22 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ambra1A2AH22 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ambra1A2AH22 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ambra1A2AH22 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ambra1A2AH22 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ambra1A2AH22 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ambra1A2AH22 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ambra1A2AH22 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ambra1A2AH22 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ambra1A2AH22 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ambra1A2AH22 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Ambra1A2AH22 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ambra1A2AH22 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ambra1A2AH22 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ambra1A2AH22 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ambra1A2AH22 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ambra1A2AH22 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ambra1A2AH22 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms