Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ckap5A2AGT5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ckap5A2AGT5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ckap5A2AGT5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ckap5A2AGT5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ckap5A2AGT5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ckap5A2AGT5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ckap5A2AGT5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ckap5A2AGT5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ckap5A2AGT5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ckap5A2AGT5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ckap5A2AGT5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ckap5A2AGT5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ckap5A2AGT5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ckap5A2AGT5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ckap5A2AGT5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ckap5A2AGT5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ckap5A2AGT5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ckap5A2AGT5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ckap5A2AGT5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ckap5A2AGT5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ckap5A2AGT5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ckap5A2AGT5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ckap5A2AGT5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ckap5A2AGT5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ckap5A2AGT5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ckap5A2AGT5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ckap5A2AGT5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ckap5A2AGT5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ckap5A2AGT5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ckap5A2AGT5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ckap5A2AGT5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ckap5A2AGT5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ckap5A2AGT5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ckap5A2AGT5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ckap5A2AGT5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ckap5A2AGT5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ckap5A2AGT5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ckap5A2AGT5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ckap5A2AGT5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ckap5A2AGT5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ckap5A2AGT5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ckap5A2AGT5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ckap5A2AGT5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ckap5A2AGT5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ckap5A2AGT5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ckap5A2AGT5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ckap5A2AGT5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ckap5A2AGT5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ckap5A2AGT5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ckap5A2AGT5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ckap5A2AGT5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ckap5A2AGT5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ckap5A2AGT5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ckap5A2AGT5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ckap5A2AGT5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ckap5A2AGT5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ckap5A2AGT5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ckap5A2AGT5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ckap5A2AGT5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ckap5A2AGT5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ckap5A2AGT5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ckap5A2AGT5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ckap5A2AGT5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ckap5A2AGT5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ckap5A2AGT5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ckap5A2AGT5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ckap5A2AGT5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ckap5A2AGT5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ckap5A2AGT5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ckap5A2AGT5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ckap5A2AGT5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ckap5A2AGT5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ckap5A2AGT5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ckap5A2AGT5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ckap5A2AGT5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ckap5A2AGT5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ckap5A2AGT5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ckap5A2AGT5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ckap5A2AGT5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ckap5A2AGT5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ckap5A2AGT5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ckap5A2AGT5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ckap5A2AGT5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ckap5A2AGT5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ckap5A2AGT5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ckap5A2AGT5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ckap5A2AGT5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ckap5A2AGT5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ckap5A2AGT5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ckap5A2AGT5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ckap5A2AGT5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ckap5A2AGT5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ckap5A2AGT5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ckap5A2AGT5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ckap5A2AGT5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ckap5A2AGT5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ckap5A2AGT5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ckap5A2AGT5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ckap5A2AGT5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.3 ms